苜蓿全基因组牺犚犓犊转录因子基因的分析-草业学报.pdfVIP

第 卷 第 期 草 业 学 报 ２０ ３ ２１１－２１８ 　 　 　 　 ， 　　 年 月 Ｖｏｌ．２０Ｎｏ．３ ＡＣＴＡＰＲＡＴＡＣＵＬＴＵＲＡＥＳＩＮＩＣＡ ２０１１ ６ 苜蓿全基因组犠犚犓犢转录因子基因的分析 江腾，林勇祥，刘雪，江海洋，朱苏文 （安徽农业大学生命科学学院 安徽省作物生物学重点实验室，安徽 合肥 ２３００３６） 摘要：蒺藜苜蓿的基因组较小，遗传转化相对容易，是国际上广泛用于研究豆科植物的模式植物，其全基因组测序 已经完成。 转录因子是近年来在植物中发现的 端含有 高度保守氨基酸序列的新型转录调 ＷＲＫＹ Ｎ ＷＲＫＹＧＱＫ 控因子，调节启动子中含 Ｗｂｏｘ元件的调节基因和（／或）功能基因的表达，从而参与植物的各种防卫反应。本研 究以苜蓿基因组序列（ ）为材料，利用生物信息学方法分析苜蓿全基因组 转录因子基因的数目、种类、 Ｍｔ２．０ ＷＲＫＹ 系统发生学、保守基序，结果表明，苜蓿中共有 个 基因，其中 个基因含有 个 结构域，共含有 ２８ 犠犚犓犢 ５ ２ ＷＲＫＹ 个 结构域，根据其结构域特点可以分为 个大类，同时与水稻 基因进行了比较研究，发现基因数 ３３ ＷＲＫＹ ３ 犠犚犓犢 目远少于拟南芥和水稻，同时研究证实苜蓿与水稻犠犚犓犢基因的起源和进化关系存在较大差异，显示出苜蓿 进化有其独特的特点，此外分析苜蓿 基因的保守 共有 个，筛选得到 结构域的 个 ＷＲＫＹ 犠犚犓犢 ｍｏｔｉｆ ４６ ＷＲＫＹ ５ 保守 。该研究对苜蓿 基因功能的研究及进化具有重要的意义。 ｍｏｔｉｆ 犠犚犓犢 关键词：苜蓿； ；系统发生树；生物信息学 ＷＲＫＹ 中图分类号： ＋ ； 文献标识码： 文章编号： （ ） Ｓ５５１．７５３Ｑ９４３．２ Ａ １００４５７５９２０１１０３０２１１０８ 　　 　　  转录因子在高等植物的生长发育及其对外界环境的反应中起着重要的调控作用，典型的高等植物转录因子 　 含有 ＤＮＡ结合域、转录调控域、寡聚化位点和核定位信号，转录因子通过这些结构域与顺式元件相互作用调控 ［，］ １２ 基因的表达。转录因子也称反式作用因子，其主要功能是激活或抑制基因的转录效应 。ＷＲＫＹ蛋白是植物 所特有的转录因子家族。因 结构域是一