玉米转录因子abp9基因的bac克隆鉴定及染色体定位-生物技术进展.pdfVIP

玉米转录因子abp9基因的bac克隆鉴定及染色体定位-生物技术进展.pdf

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生物技术进展 2016年  第6卷  第6期  435~442 研究论文 Current Biotechnology  ISSN2095 ̄2341 Articles 玉米转录因子ABP9基因的 BAC克隆鉴定及染色体定位 1 2 1 2 1∗ 蒲妍君 ꎬ  袁  静 ꎬ  庞军玲 ꎬ  韩方普 ꎬ  赵  军 1.中国农业科学院生物技术研究所ꎬ北京 100081ꎻ 2.中国科学院遗传与发育生物学研究所ꎬ北京 100101 摘  要: 为得到玉米转录因子ABP9 的准确基因组序列及其旁侧基因组序列ꎬ应用PCR 法对玉米自交系齐319 BAC 文 库中含有ABP9基因的单克隆进行筛选ꎬ得到了19个一级阳性混池ꎬ从中选择BAC ̄103、BAC ̄159进一步筛选获得了4 个阳性单克隆ꎮ 以其中1个阳性单克隆BAC ̄103 ̄C3为模板进行全序列测定ꎬ比对分析后将ABP9基因初定位于玉米自 交系Mo17基因组的3号染色体上ꎮ 另以玉米自交系齐319、自交系Mo17萌发种子的根尖染色体滴片为材料ꎬ以绿色荧 光标记的ABP9基因ORF 区质粒DNA 为探针进行荧光原位杂交ꎬ确认在这2个自交系中ABP9 基因定位于3 号染色体 上ꎮ ABP9基因组序列的获得及其染色体定位为该基因分子标记的开发及应用于分子育种奠定了基础ꎮ 关键词:ABP9基因ꎻBAC文库ꎻ染色体定位ꎻ荧光原位杂交ꎻ分子育种 DOI:10.3969/j.issn.2095 ̄2341.2016.06.08 BACClone Identification and Chromosomal Localizationof Maize Transcription FactorABP9 1 2 1 2 1∗ PU Yan ̄jun ꎬYUANJing ꎬPANGJun ̄ling ꎬHAN Fang ̄pu ꎬZHAOJun 1.Biotechnology Research InstituteꎬChineseAcademy of Agricultural SciencesꎬBeijing 100081ꎬChinaꎻ 2.Institute of Genetics and Developmental BiologyꎬChineseAcademy of SciencesꎬBeijing 100101ꎬChina Abstract:In order to obtain the accurate genomic sequence and its flanking genomic sequences of maize transcription factor ABP9ꎬPCR method was used to screen the BAC library of maize inbred line Qi319 for identification of single BACs which containABP9. Asaresultꎬfourpositive single BACswereobtainedfromtworandomly selectedamong 19positiveprimary poolsꎬ namely BAC ̄103ꎬBAC ̄159. By sequencing and sequence alignment of single clone BAC ̄103 ̄C3with Mo17 genomeꎬABP9was mapped on chromosome 3of Mo17.Thisresultwasconfirmedbyfluorescenceinsituhybridizationusinggreenfluorescent ̄labeled ABP9 ORF a

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