IL—10启动子基因在云南傣族、哈尼族人群中遗传多态性.docVIP

IL—10启动子基因在云南傣族、哈尼族人群中遗传多态性 　　[摘要] 目的 分析云南省西双版纳地区傣族和哈尼族人群IL-10启动子基因多态性的分布情况。 方法 运用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术检测傣族和哈尼族人群IL-10启动子rs1800871和rs1800896位点基因型及等位基因频率。结果 傣族与哈尼族人群rs1800871和rs1800896位点基因型与等位基因分布频率显著不同，差异有统计学意义（rs1800871：χ2分别为7.023和7.373，P分别为0.030和0.007；rs1800896：χ2分别为6.184和5.870，P分别为0.013和0.015）。 结论 IL-10启动子rs1800871和rs1800896多态性位点基因型和等位基因分布频率具有民族、种族差异。 [关键词] 白细胞介素10；启动子；基因多态性；少数民族 [中图分类号] RQ343.12 [文献标识码] B [文章编号] 1673-9701（2013）20-0034-03 不同人群具有不同的遗传背景，人类基因多态性造成了不同人群对疾病易感性的差异。白细胞介素10（interleukin-10，IL-10）是由Th2细胞产生的一种具有多效性的免疫调节性细胞因子，对机体的免疫调节具有免疫促进和免疫抑制双重作用。其启动子区域rs1800871和rs1800896位点的多态性可影响IL-10基因的转录活性和血浆IL-10水平[1，2]，与多种疾病的发病率、临床进展和预后密切相关。本文以运用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术 （Matrix-Assisted Laser Desorption/Ionization Time of Flight Mass Spectrometry，MALDI-TOF-MS）检测了西双版纳地区傣族和哈尼族人群这两个SNP位点的基因型和等位基因分布频率，为寻找疾病易感基因提供了群体遗传学数据。 1 对象与方法 1.1 研究对象 在知情同意的原则下，采集云南省西双版纳地区健康、纯系且无亲缘关系傣族、哈尼族人群血样600份，其中傣族300例，男117例，女183例，年龄（37.3±17.1）岁；哈尼族300例（男127例，女173例），年龄（33.6±17.4）岁。所有观察人员均静脉抽取EDTA-K2抗凝静脉血3 mL， 充分混匀后-20℃保存备用。 1.2 Il-10 rs1800871和rs1800896位点多态性分析 全血标本用全血基因组提取试剂盒（百泰克DP1801）提取基因组DNA作为模板，采用MALDI-TOF-MS技术 对IL-10启动子rs1800871和rs1800896位点进行基因分型。首先进行PCR扩增，其中引物浓度为0.1 μmol/L，HotStar Taq 1 U，dNTP浓度为0.5 μmol/L，MgCl2 浓度为1.625 mmol/L，DNA 模板10 ng。PCR 反应的条件为94℃ 15 min；94℃20秒，56℃30秒，72℃ 1 min，45 个循环；72 ℃延伸3 min。随后将扩增后的产物进行SAP纯化后进行延伸反应，其中伸反应引物0.84mol/L，iPlex酶1U，反应条件为94 ℃ 30秒 ；94℃5 秒 ，52℃ 5 秒，40个循环；80℃ 5 秒，5 个循环；72℃延伸3 min。反应结束后每个延伸反应产物经树脂纯化后于芯片上点样，MassARRAY Analyzer质谱检测相应位点的基因型。PCR引物和延伸引物见表1。 1.3统计学分析 采用SPSS11.7统计软件处理，组间比较采用χ2检验，P 0.05），样本具有代表性。rs1800871三种基因型均有检出，而rs1800896位点只有AA和GA基因型，结果见图1。 2.2 不同种族人群IL-10启动子rs1800871和rs1800896位点基因型和等位基因分布频率比较 傣族人群两SNP位点基因型与等位基因分布频率均与哈尼族显著不同，差异有统计学意义（P均0.05），与日本人群有显著性差异（P0.05），而与意大利人、芬兰人和哥斯达黎加人群差别极其显著（（P0.05），与意大利人、西班牙人和突尼斯人群差别极其显著（（P 　　很多疾病的发生、发展和转归存在明显的人群和地域差异，这与人群遗传背景密切相关。SNP作为第三代遗传标志，其在不同人群中的分布及与疾病的相关性研究有助于我们认识疾病易感性差异的原因。云南西双版纳是一个多民族杂居的地区，由于地理环境的特殊、交通的不便以及民族习惯和文化的差异，民族间极少通婚，因此形成了遗传学上的原生态隔离种群，是非常好的人群基因结构与疾病认识的地区。我们的研究以傣族和哈尼族这两个原生态隔离