D13S317基因座“off—ladder”等位基因分析.pdfVIP

沈阳医学院学报 JournalofShenyangMedicalCollege 第 15卷 第4期 2013年 12月 D13S317基因座 “off—ladder等位基因分析 黄洪武，徐振亮，朱诣琦 (江苏省昆山市公安局，江苏 昆山 215300) [摘要]目的：确证在DNA数据库构建过程 中一样本 D13S317基因座出现的稀有分型标准物外off-ladder(OL)等位基 因。方法：AGCU17+1STR荧光检测试剂盒进行 STR分型时，D13S317基 因座检 出OL等位基因；利用Chelex一100法提取 血样DNA进行 荧光PCR，应用聚丙烯酰胺凝胶 电泳和ABI3130电泳检测并由上海生工进行测序。结果：OL等位基因只含 有6个 [TATC]重复，不在D13S317基因座AllelicLadder范围之 内，是一个新的等位基因。结论：新的等位基因的出现， 对扩大DNA数据库的覆盖范围及全面性和提高基因座个体iT,~J4能力等具有重要的借鉴意义。 [关键词]D13S317基 因座；AGCU17+1试剂盒；off-ladder等位基 因；STR—PCR [中图分类号]R394．5 [文献标识码]A [文章编号]1008—2344(2013)04—0205—03 doi：10．3969／j．issn．1008—2344．2013．04．005 AnalysisofOff-ladderAlleleFoundon theD13S317Locus HUANG Hongwu，XU Zhenliang，ZHU Yiqi (KunshanPublicSecurityBureau，Kunshan215300，China) [Abstract]Objective：Tocertifytherareoff-ladder(OL)allelesfoundontheD13S317locusduringtheDNAdatabasecon— struction．M ethods：OLallelewasscreenedbyusingAGCU 17+1system kit，Chelex一100wasusedtoextractDNAfrom theblood sampleforfluorescencepolymerasechainreaction．ThePCRproductsweredetectedbyPAG verticalelectrophoresandABI3130ge— neticanalyzer，sequencingbyShanghaiSangon．Results：OLalleleonlycontainedsixrepeatsof[TATC]withouttherangeof D13S317 allelicladderwhichmeantitwasanewallele．Conclusion：ThediscoveryandtypingofOLalleleisgreatsignificanttoex— pandcoverageandcompletenessofDNA databaseandimprovethelociindividualrecognitionability． [Keywords]D13S317locus；AGCU17+1systemkit；off-ladderallele；STR—PCR 短串联重复序列 (shorttandemrepeat，STR) 1 材料与方法 是广泛存在于人类基因组中的一类具有高度多态 性的遗传标记。其核心序列 (重复单位)的重复 1．1 血样 DNA数据库建设过程中的个体血样。 数 目存在差异，一般每个位点有近十个到十几个 1．2 主要试剂及仪器 ABI3130毛细管测序仪 等位基因，以孟德尔共显性方式遗传，在人类基 (ABI公司)，PCR仪 (博 日公司)，凝胶 电泳系统 因组中，大约每隔 6～10kb就 出现一个 STR位 (北京 六一 仪器)，Chelex-100 (Bio—rad公 司)， 点 ¨。STR分型具有检测灵敏度高，适宜微量、 AGCU17+1STR荧光检测试剂盒 (AGCU公司)， 腐败降解材料鉴定的优点 J，凭借其操作简单、 LB平板培养基，5％的非变性聚丙烯酰胺凝胶 。 便于控制及标准化的技术，成为 国内外法医学界