染色体基因芯片的临床相关应用.ppt

FISH(快,特异性) High resolution…usually 200 kb, and fairly objective MUST know where to look 图 案例分析 Case 1 胎儿多发畸形，染色体核型正常arr 18p11.32-p11.31(419,598-4,925,310)×1 [hg19]微阵列结果显示在18号染色体短臂p11.32-q11.31存在大约4.5Mb的缺失,该拷贝数变异区域涵盖23个已知基因,包括 TYMS,NDC80, DLGAP1等剂量敏感的基因。 Zhou Yi, Xie Yingjun，et al. GENE,2014 Zhou Yi , Xie Yingjun，et al. GENE,2014 三种临床遗传检测技术并存 关系（检测效能-取代？互补？） 临床应用（先后？） 反复流产 :核型，SKY， 多发畸形：CMA，核型 智力低下：CMA，核型，脆性X CytoScan可以检测的部份染色体微小缺失异常综合征 （列举部分） 1p36.3 单体1p36的综合征 5q35 索托综合征 7q11.2 威廉氏症候群、高钙血症主动脉瓣上部狭窄症候群 9q22.3 大综合征,增生综合征的例子包括神经纤维瘤，索托斯扎克综合症 11p13 WAGR综合征, 泌尿生殖系统异常,肾母细胞瘤,无虹膜,智力低下 11p15.5 魏德曼综合征,脐疝-巨舌-巨人症综合征,脐膨出综合征 15q11.2 安格曼症候群,智力和发育迟缓，睡眠障碍，癫痫发作,拍手,微笑 15q11.2 普瑞德威利综合征,肌张力减退,身材矮小,多食,肥胖，性腺功能减退 16p11.2 自闭症 16p13.3 鲁宾斯坦综合征:智力和运动发育迟缓,拇指与大趾增宽,身材矮小 17p13.3 米-迪综合征,无脑回畸形,不完全神经细胞迁移造成大脑发育缺陷 17p11.2 史密斯马盖尼斯综合征, 精神发育迟滞，独特的面部特征，睡眠障碍 17q11.2 1型神经纤维瘤病 20p12 阿拉吉耶综合征: 影响肝脏，心脏和身体的其他系统 22q11.2 软腭-心-面综合征/迪格奥尔格综合征 3q26.3 3q26.3重复综合征, 智力缺陷 ,上颚,鼻孔,心肾脏异常 11p15.5 魏德曼综合征, 巨舌, 耳朵皱，低血糖症，肿瘤, 学习困难 mos iso12p 帕利斯特-基利安综合征, 高前额,粗面, 头发稀疏, 眼距宽，宽鼻梁有高腭 穹,智力迟钝, 肌张力丧失 The end 谢谢 ACMG:American College of Medical Genetics美国遗传医学学院；ISCA:细胞遗传学芯片国际标准联合会The International Standards for Cytogenomic Arrays Key message: The first papers quickly showed that using SNP arrays had added benefit – the detection of heterozygosity gave a greater insight. This example is from cancer and they used a low res SNP array but their early conclusion is now being repeated by the constitutive cyto community using high-res SNP arrays. Abstract: Bignell et al Genome Res 2004; 14: 287–295 Genomic copy number alterations are a feature of many human diseases including cancer. We have evaluated the effectiveness of an oligonucleotide array, originally designed to detect single-nucleotide polymorphisms, to assess DNA copy number. We first showed that fluorescent signal from the oligonucleotide array varies in proportion to both decreases and increases