关于在分子生物化学与工程领域里若干理论问题的研究II——在人类基因组DNA、RNA原始合成中微观共聚反应机理的考察研究.pdfVIP

关于在分子生物化学与工程领域里若干理论问题的研究(II) ——在人类基因组DNA 、RNA 原始合成中微观 共聚反应机理的考察 金日光 赵军 蔡晴 李琴 牟雪雁 （北京化工大学生命动力研究中心，教育部可控化学反应重点实验室，北京 100029） 引言 包括人类在内在一切生物体的遗传基因载体，都由A、G.、C、T（U）的脱氧 核苷酸（核苷酸）单体的共聚而成。共聚结果出现了各种序列分布方式4n ,其中聚合 度n 越大，排列方式越多。就拿病毒DNA 而言有5000 多个碱基，其中仅一种排列 方式就可以排列出一页满满的排列方式，如把所有的排列方式全部加在一起，那么 3000 51 就有 10 个排列方式，这远比地球的所有原子数 10 还多得多；目前知道人类基 9 因组由30×10 碱基对组成DNA 高分子链。仅仅这些碱基的某种排列方式就可以列 在 50 万页的书中。所以如果按随机过程进行，那么各种排列方式就不可估量，但 是自然界总不是那么杂乱无章而有高度的和谐性和稳定性。对此我们可以用下列模 式来表示某种DNA 聚合物高分子链的序列方式： 1 应该说在远古时，最初这些无数个 DNA 链是经历了漫长时间，甚至在没有生 物酶而只有一些各种含d 和f 轨道的生命相关的含水络合离子催化激活的环境下形 成的。那么，可以想象人们总可以从上述无数个DNA 链中找到某种DNA 链是今天 构成人类基因的最原始、尚未进化的遗传基因胚体，通过漫长岁月终于形成了今天 的人类基因载体 DNA、RNA。从这个意义上，四种脱氧核苷酸的共聚反应是引起 生物多样性的最根本的原因。尽管生物最初表面形态是很相似的，但是在 DNA、 RNA 某些链断的结构上已有了独特之处。从这个意义上我们很难同意生物的多样性 是在最初完全相同的 DNA 基础上逐步进化成多样化的观点，这种观点实质上否定 上述四种单体之间无数种共聚体分布的现实性。作者通过大量的计算证实人类的基 因载体DNA 及其RNA 已达到至高无上的境界：这是因为在人类基因载体中能够编 码蛋白高分子链的DNA、RNA 有效链段，它们在上述无数个共聚链的合成路线中 选择了下列任何其他生物体所没有的三大类别的DNA、RNA 合成的路线： （1）、富含C＋G 的DNA、RNA 链段的合成与选择 在类似人类细胞核反应环境中 （2）、富含T(U)+A 的DNA、RNA 链段的合成与选择 （3）、富含C＋A 的DNA、RNA 链段的合成与选择 在类似人类线粒体反应环境中 2 但是在当代分子生物学领域里大家关注的是目前人类细胞体内已经形成的 DNA 如何复制，RNA 如何被录制，m-RNA 如何合成蛋白体的问题，而很少有人研 究这些DNA、RNA 在最“原始汤”里合成时的微观反应环境如何影响四种碱基排 序的根本问题。作者看来不同微观化学反应环境造就了上述不同的DNA、RNA 链 段的合成，如（1）作者发现在类似人类细胞核中，即在有一定的弱碱性或者接近 中性而又有极性介质的环境下，四种碱基脱氧核苷酸（核苷酸）单体是通过氢键和 色散动力大小的竞争作用，共聚成富含 C＋G 的DNA、RNA 的链段；（2）作者又 发现在类似人类线粒体一样有水和各种极性介质环境下，通过四种碱基脱氧核苷酸 （核苷酸）单体的色散动力大小的竞争作用，合成出富含 A＋C 的 RNA（DNA） 链段；（3）作者还发现在类似人类细胞核中当处于高度极性或局部磷酸化的微观反 应环境时，四种单体通过某些异构化过程使色散作用能起主导作用，从而共聚出富 含T（U）＋A 的DNA、RNA 链段，这是人类独有的基因载体特色。作者发现对其 他生物而言常常通过上述三种情形混杂作用，形成高频