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实时荧光RT-PCR与细胞培养法在流感病毒检测中的应用
精品论文 参考文献
实时荧光RT-PCR与细胞培养法在流感病毒检测中的应用
邵阳市疾病预防控制中心 湖南邵阳 422000
【摘 要】目的:探究实时荧光RT-PCR与细胞培养法在流感病毒检测中的应用价值。方法:从本中心2012年7月至2015年10月接收的流感样病例收集的咽拭子样本中,随机抽取采集时间在发病3天内的标本300份,采用实时荧光RT-PCR进行流感病毒核酸检测,并进行比较两种方法对于流感病毒检测差异。结果:在本次选取的300份标本中,实时荧光RT-PCR阳性检出共84份,阳性检出率为28.00%,通过MDCK细胞培养阳性检出共35份,阳性检出率为11.67%,组间统计学分析具有显著性差异(P<0.05)。结论:研究表明,实时荧光RT-PCR与细胞培养法对于流感病毒的检测均具有一定的特异性,且前者可以作为流感病毒核酸检测的一种快速有效的手段,并且适用于公共卫生疫情监测实验室诊断,而细胞培养法可以作为流感病毒监测的基础。
【关键词】实时荧光RT-PCR;细胞培养法;流感病毒检测;应用价值
流行性感冒病毒(influenza virus)简称流感病毒,可引起急性呼吸道传染病-流行性感冒(简称流感)。流感为我国法定的乙类传染病,是国际上第一个实现全球监测的、并且至今无法完全加以控制的一种病毒性急性呼吸道传染病,所以能够有效地分离和鉴定流感病毒已成为流感病毒的监测和临床诊断的前提[1]。临床常采用细胞培养法以及实时荧光RT-PCR对流感病毒进行分离、检测,为进一步探究实时荧光RT-PCR与细胞培养法在流感病毒检测中的应用价值,特进行如下研究:
1 资料与方法
1.1样本来源 从本中心2012年7月至2015年10月接收的流感样病例收集的咽拭子样本中,随机抽取采集时间在发病3天内的标本300份,其中男性164例,女性136例,年龄在3—67岁不等,平均年龄为(43.34plusmn;3.43)岁。
1.2器械和试剂 采用的器械主要包括ABI 7500荧光定量扩增仪、二氧化碳培养箱以及倒置显微镜。①PCR:提取试剂 QLAGEN RNeasy Mini Kit,扩增试剂Invitrogen super-Script Ⅲ platinum one-step qRT-PCR,甲、乙型流感病毒核酸检测试剂盒(生产厂家:江苏硕士生物科技有限公司),试剂均在有效期内;②细胞培养:MDCK细胞、抗A(H1N1)、(H3N2)、(SWH1)亚型血清,抗B型Yamagata以及Victoria系病毒血清,胎牛血清等。
1.3方法 ①实时荧光RT-PCR法:对已经采集的咽拭子样本实施检测,参照试剂盒中说明书进行操作,采用QLAGEN RNeasy Mini Kit提取样本,并通过反应体系进行配置,然后采用ABI 7500荧光定量扩增仪扩增。操作条件为:50℃30min、95℃5mi预变性、95℃10s变性、55℃40s退火延伸及检测,55℃收集荧光。反应液为7.5ul,酶混合液为5ul,去RNA酶水为3.5ul,甲、乙型流感反应液为4ul,病毒核酸模板RNA为5ul,总体积为25ul。②细胞培养法:采用无菌移液管将细胞Hank,s液移出细胞培养瓶,然后取适量临床标本置于细胞培养瓶中,然后摇动数次后放置于37℃环境的5%二氧化碳培养箱中1小时,吸出接种物后,采用Hankrsquo;s液清洗细胞2遍,然后将病毒生长液放置在细胞培养瓶中,随后进行培养,每天观察细胞的变化,在有75%-100%的细胞发生病变时开始收获,进一步判断流感病毒的亚型。
1.4统计学分析处理 应用统计学软件SPSS18.0对本次研究所得数据进行统计学分析处理;计数资料用chi;2检验,用(n,%)表示;Plt;0.05表示差异有统计学意义。
2.1不同检测方法流感病毒阳性检测以及不同亚型检测结果比较 本次选取的300份样本经过不同检测方法检测后,实时荧光RT-PCR阳性检出共84份,阳性检出率为28.00%,通过MDCK细胞培养阳性检出共35份,阳性检出率为11.67%,组间统计学分析具有显著性差异(P<0.05)。详细分析结果见下表1:
3 讨论
流感病毒分离鉴定是较为经典的实验室诊断手段,也是流行病学监测的基础,其在流感病毒临床诊治领域也具有重要的指导意义。截止目前,流感病毒分离的主要方法有鸡胚培养法和细胞培养法,并且后者也是流感病毒监测的金标准[2],且已经成为流感病毒抗原性以及基因特异性、耐药性等方面研究的必要手段[3]。在社会经济迅猛发展的趋势下
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