适于核桃的RAPDPCR反应体系的建立.pdfVIP

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  • 2018-01-11 发布于广东
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适于核桃的RAPDPCR反应体系的建立 59 适于核桃的RAPD-POR反应体系的建立 张虎平1牛建新1王国安2虎海防2马兵钢1朱军 (1新疆石河子大学农学院园艺系,石河子832003:2新疆林业科学院,乌鲁木齐832000) L)特异性状的相关基田进行分子标记研究,采用CTAB 摘要:为了对核桃(Juglansregia 法和改进的CTAB法,从叶片中提取核桃基因组DNA,比较其分离效果。结果表明,改进的 CTAB法可有效去除细胞内多糖和多酚等杂质对模板DNA的污染。并以此为模板进行RAPD 反应,对RAPD反应程序中的一些重要参数进行摸索和优化试验,建立适合于核桃的 RAPD-PCR反应体系,以进行该树种的分予标记研究。 关键词:核桃:DNA提取;RAPD L.)栽培历史悠久,在长期的进化与栽培过程中表现出了特有的 核桃(aruglansregia 优良性状.如早实特性(石荫坪等,1999:奚声珂,1987)和孤雌生殖特性,蕴藏着许多非 常宝贵的控制优良性状的基因资源。对核桃特异性状的基因进行分子标记,不仅为今后核桃 种质资源的开发研究提供一定的理论依据和实践基础.而且借助基因分离和克隆技术可用于 作物的品种改良。 DNA,随机扩增多 20世纪90年代后发展起来的RAPD(RandomAmplifiedPolymorphic 态性DNA)技术简单易行,可快速寻找两组DNA样品问多态性差异,进而得到与此差异区域 相连锁的DNA标记,这样利用RAPD即可定位在某一特定DNA区域内的特定基因…。但RAPD 反应体系中各组分的浓度、DNA扩增中各步骤的温度和时间等,均会直接影响扩增效果”1。 因此,DNA的提取和PCR扩增条件的优化和可靠性,是对任何一个物种进行RAPD研究必须首 先解决的关键问题。本文研究了用于核桃RAPD—PCR实验所需ON的提取方法和PCR最优化 反应体系的建立,为其后的研究做必要的准备。 l材料与方法 1.1试验材料 供试材料由新疆林业科学院提供,叶片于10月中旬分别采自6个表型不同的植株,带 回实验室后置一70C冰箱中备用。 1 2 DNA提取方法 1.2.1 CTAB法各样品称取0.19,去除叶脉后参照既有的研究结果”’”提取DNA。取DNA 原液20 1.2.2改进CTAB法为克服多糖和多酚等对DNA质量的影响,本研究参考一些研究文 基金项目:新疆自然科学基金资助项目(211003) 160 干果研究进展(3) 1 迅速研磨至粉末,将冻粉迅速转入预冷的1.5ml离心管中,加入50B一巯基乙醇(BME), 5min。弃去上清夜,加入700 出加入700 1.5m]离心管中,加入1/5V5MNaCl后混匀,然后加入2/3V异丙醇,静置使DNA沉淀。室温 1TE和200 离心弃上清液后(可用适量70%乙醇洗2次)加入400 15MNaCl使沉淀溶解,加 入RNaseA(10g/m1),37℃水浴30min后加入等体积的苯酚一氯仿(1:1)和氯仿各抽提一次。 洗2~3次,室温干燥后溶于501TE(10mMTds.CI,0.1mMEDTA),一20℃保存。 1.3 RAPD扩增反应 KCl,100mM dNTP pH9.0,25℃Tris.Cl,1.0%TritonX-100)2.59l,25mMMg“3.59l,2.5mM EB的1.5%琼脂 1.3.2取25¨lPCR扩增产物与1山Loadingbuffer混匀,点入含有O.5pg/ml 糖凝胶中,在3V/cm电场强度下电泳4h,于紫外检测仪上观察并用Kodak数码相机照相记 录。 2结果与分

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