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鱼类DNA条形码技术的应用进展 陈信忠 郭书林 龚艳清 厦门出入境检验检疫局 X 关注成功！ 加关注后您将方便地在 我的关注中得到本文献的被引频次变化的通知！ 新浪微博 腾讯微博 人人网 开心网 豆瓣网 网易微博 关键词： 鱼类; DNA条形码; 物种鉴定; 鱼类产品标识; 进展; 作者简介：陈信忠 (1964-) , 男, 研究员, 博士;研究方向:海洋生物学.E-mail:chenxz@xmciq.gov.cn. 收稿日期：2016-12-26 基金：福建省农业引导性 (重点) 项目 (2015N0015) Progress on Application of Fish DNA Barcoding:a Review CHEN Xinzhong GUO Shulin GONG Yanqing Xiamen Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau; Keyword： fish; DNA barcoding; species identification; labeling of fish product; progress; Received： 2016-12-26 基于DNA序列进行物种鉴定的DNA条形码技术自2003年问世以来, 经过十几年的快速发展, 不仅在各种动植物的物种鉴定方面取得巨大成就, 而且在动植物区系、生态和物种保护、生物安全、食品安全等方面得到越来越多的应用, 并取得一系列成果。鱼类是最具多样性的脊椎动物, 全球预计有多达40000种鱼类[1]。由于在发展过程中具有高度的多样性, 传统的鱼类物种鉴定方法存在很多问题。DNA条形码在鱼类物种鉴定中最早获得应用。2005年开始实施的鱼类生命条形码计划 (FISH-BOL) 是一项国际合作计划, 通过采用经过权威的分类鉴定的标本, 研究鱼类线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ亚基 (COⅠ) 基因, 以电子数据库形式构建含有DNA条形码、图像和地理坐标的全球鱼类参考标准数据库, 应用DNA条形码简化鱼类识别工作, 重点解决传统形态学方法无法鉴别的难题。鱼类生命条形码计划还特别关注市场上物种替代和商业渔业管理等社会问题[2]。鱼类DNA条形码在濒危物种保护, 防止外来物种入侵等方面也得到越来越多的应用。不过, 该技术在鱼类近缘物种以及亚种水平的鉴定方面还有一定的局限性。我国的鱼类DNA条形码研究相对较少, 目前主要在少数鱼类鉴别以及小流域鱼类区系方面取得一些进展, 在其他领域的应用还很少, 尚未建立系统、完善的数据库。但我国是水产养殖和渔业大国, 也是观赏鱼主要生产国和出口国。我国每年引进大量的鱼类物种进行人工繁育和种质资源改良。另一方面, 我国有众多不同的水域环境和鱼类区系。因此, 应用最新的鱼类鉴别和分类技术, 对我国水产养殖业的健康发展以及鱼类资源和生态环境的保护等方面均具有重要指导意义。 1 鱼类DNA条形码的应用 1.1 DNA条形码在鱼类分类中的应用 鱼类DNA条形码最重要的作用就是对鱼类进行准确鉴别, 弥补传统形态学鉴定方法的不足, 发现或纠正传统分类学中隐含的错误, 明确全球主要水域的鱼类的种类、发展历史以及与生态环境的相互作用, 为有效利用鱼类资源, 保护鱼类多样性提供科学依据。DNA条形码技术与传统形态学分类方法相结合, 不仅可以快速、准确的对物种进行鉴定和分类, 还可能发现许多潜在的物种。以DNA条形码为主要技术的鱼类生命条形码系统为鱼类学学科理解各种鱼类的自然史和生态相互作用提供了一个有力的工具。 理想的DNA条形码首先要求具备适宜的序列变异水平, 可以区分不同物种而且种内变异较小;其次, 要求变异区域两端具有高度保守的序列, 可以设计通用的扩增引物;第三, 还要求较短的扩增序列。根据已有研究, COⅠ基因是鱼类分类与鉴别的理想DNA条形码[3]。鱼类生命条形码计划已对已知的31 000种鱼类中的8000种鱼类的COⅠ基因条形码进行了测定, 这些鱼类涵盖了全球绝大多数重要的商业物种。现有的研究结果表明, 应用COⅠ条形码可以有效区分约98%的海洋鱼类和93%的淡水鱼类[1]。除了COⅠ基因, 其他可用于鱼类DNA条形码的基因包括细胞色素B (Cyt B) 、NADH脱氢酶亚单位2 (ND2) 和兰尼定受体3 (RYR3) 等[4]。但由于COⅠ基因比其他基因更适合作为鱼类鉴别的基因条形码, 可以鉴别绝大多数鱼类, 因此至今针对其他基因条形码的研究还很少。 1.2 DNA条形码在鱼类区系研究中的应用 DNA条形码技术对构建不同国家和地区的江河湖海等流域的鱼类区系数据库具有重要价值。全球鱼类种群和数量最丰富的地区包括南美洲、非洲和亚洲等地区。近年来南美地区鱼类区系的研究报告相对较