基于SVM的生物医学命名实体的识别研究.pdfVIP

V01．27 第27卷增刊 哈尔滨工程大学学报 Suppl． JournalofHarbin Jul．2006 2006年7月 EngineeringUniversity 基于SVM的生物医学命名实体的识别 王浩畅，赵铁军 (哈尔滨工业大学计算机与技术学院，黑龙江哈尔滨150001) 摘要： 命名实体识别是生物医学数据挖掘的基本任务．文章使用了基于支持向量机的方法对生物医学文本中的命名实体进 行了识别，系统中结合了丰富的特征集，包括局部特征，全文特征和外部资源特征，对不同的特征和不同的特征组合对系统 的贡献进行了评测和实验．为了进一步提高系统的性能，还引入了缩写词识别模块和过滤器模块．实验结果表明，该方法对生 物医学文本中命名实体的识别取得到了较好的结果． 关键词： 命名实体识别；SVM；特征选择；缩写词 中图分类号：TP391文献标识码：A 文章编号：1006-7043(2006)增一0570—05 SVM-basedbiomedicalname entityrecognition WANG Hao—chang，ZHAOTie-jun (School Scienceand Institute ofComputer Technology,Harbin inbiomedicaldata a Vector Abstract：Name is afundamentaltask recognition mining．ThispaperpresentsSupport entity Machine．basedmethodto name inbiomedicaltexts．Inthis richsetof local identifyentity study，a features，including text externalresourcefeaturesareused。Anddifferentfeaturesandcombinationsoffeaturesare features，and theabbreviationmoduleandfiltermoduleareintroducedto ofthe results system．Theexperimental recognition improveperformance showthatthe hasbetter system performance． selection；abbreviation Keywords：nalTleentityrecognition；SVM；feature 生物医学领域的命名实体识别是生物医学信 带来了很大的困难；生物医学命名实体还存在着嵌 息抽取的一项重要的基本任务，它的目的是从文本 套现象，因此还要解决候选命名实体的重叠的问题． 集中识别出指定类型的名称，例如蛋白质、基因、 目前已经有很多技术尝试应用到生物医学文本中 核糖核酸、脱氧核糖核酸等．完成命名实体的识别任