牛带绦虫膜联蛋白B3基因的生物信息学分析.docVIP

精品论文 参考文献 牛带绦虫膜联蛋白B3基因的生物信息学分析 戴佳琳 蓝磊 黄江 　　（贵阳医学院法医学系 贵州贵阳 550002） 　　【摘要】目的 识别牛带绦虫新基因,分析和预测该基因及其编码蛋白的结构及特性,为其生物学功能研究提供依据。方法 利用生物信息学在线分析网站、工具进行序列分析、预测其编码的膜联蛋白B3的理化特性、翻译后的修饰、功能域、亚细胞定位、拓扑结构、二级结构、三维空间构象等。结果 该基因全长1259 bp,编码区为106-1074bp,编码322个氨基酸,为全长基因;无跨膜区;蛋白质在溶液中的性质不稳定,理论分子量为36415.1;没有质体、线粒体定位序列。结论 运用生物信息学方法从牛带绦虫成虫cDNA文库中识别出了牛带绦虫成虫膜联蛋白B3基因,并对其所编码的蛋白质的结构与功能进行预测分析。 　　【关键词】牛带绦虫 膜联蛋白B3 生物信息学 　　【中图分类号】R318 【文献标识码】A 【文章编号】2095-1752（2014）12-0059-02 　　【Abstract】 Objective recognition cattle belt tapeworm new genes, analysis and forecast the gene and its coding protein structure and properties for its biological function provides the basis for the research. Methods using bioinformatics online analysis of site, tools for sequence analysis, forecasting the coded annexin B3 physical and chemical characteristics, antigen epitope, translation modifications, function domain, the subcellular localization, the topology structure, secondary structure, the three dimensional space conformation, evolutionary tree, etc. Results the gene (1259 bp, coding region for 106-1074 bp, code 322 amino acids, broke ground for the genes; No cross membrane area; Protein in solution of the nature is not stable, theory molecular weight was 36415.1; No plastid, mitochondrial positioning sequence. Conclusion using bioinformatics methods from cattle belt tapeworm imago cDNA library used to identify the cows with tapeworm imago annexin B3 gene, and the encoded protein structure and function of forecasting analysis. 　　【Key words】Taenia saginata annexin B3 bioinformatics 　　带绦虫是常见的人兽共患寄生虫，人是猪带绦虫、牛带绦虫和亚洲带绦虫的唯一终宿主，牛和猪是其主要的中间宿主。本课题组2006年以来相继构建了以上3种人体带绦虫的cDNA 质粒文库[1]，获得了大量的人体带绦虫功能基因，并把这些基因陆续登录到GenBank中，以期从分子水平探讨3种带绦虫的起源、演化和宿主选择性等问题。从牛带绦虫成虫cDNA质粒文库中挑选出膜联蛋白B3的同源基因,通过对该基因及其编码的蛋白结构和特征进行全面的生物信息学分析,为研究其生物学功能及其在牛带绦虫病的诊断、药物及疫苗研究中的应用提供依据。 　　1 材料和方法 　　1.1 材料 　　与上海联合基因有限公司合作完成牛带绦虫成虫全长cDNA质粒文库的构建、EST 测序及Unigene分析，Unigene 通过Wu-blastx 方法进行识别[2]。编码牛带绦虫成虫膜联蛋