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微生物的分子进化与分类学

第六章 微生物的分子进化 与分类学 6.1 rRNA序列分析与生物三域理论 1.rRNA分类原则与方法 (1)原核微生物:23SrRNA(2904bp) 16SrRNA(1542bp) 5SrRNA(120bp) (2)真核微生物:25SSrRNA 18SrRNA 5.8SrRNA 5SrRNA (3)rRNA特点:广泛性;遗传特性;保守性;易提取测序。 (4)分类方法:酶切和测序 2、生物三域理论 (1)原始五界系统 (2)三域系统:细菌域、古细菌域、真核生物域(Wose 建立在rRNA的研究之上)。 缺点:无非细胞形态生物 6.2 基因机构的进化 包括:启动子区域的进化、编码区的进化、非编码区的进化、内含子的进化等 6.3 分类学与命名法则 1.分类单位:界、门、纲、目、科、属、种(变种、亚种、型) DNA同源性≥70%可定为同一个种。 (G+C)%≤10-12%,16SrRNA同源性≥95%归为同一个属。 2.微生物的命名规则 林奈氏双命名法:属名+种名(拉丁) Bacillus stubtilis var.niger Saccharomyces cervisiae Hansen 5.分子分类法 (1)G+C百分含量 (2)核酸杂交 (3)16SrRNA 6.4 细菌的分类系统 1.伯杰氏分类系统(第九版) 2.原核生物分类系统 6.5真核分类系统概要 1.真菌的分类原则和依据 形态学位主、生理生化和生态学为辅的原则。 (1)丝状真菌的分类 根据:孢子产生的方式和孢子本身的特点。 A:形态形状 B:生理 C:生化 D:生态 (2)酵母的分类依据 2.真菌的分类系统 安斯沃思-真菌门:四个亚门 (1)鞭毛菌亚门(2)接合菌亚门(3)子囊菌亚门(4)担子菌亚门(5)半知菌亚门。

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