基质辅助激光解吸电离-串联飞行时间质谱鉴定鲨鱼硒结合蛋白.pdfVIP

第34卷第5期 质谱学报 V01．34No．5 2013年9月 of SeD。2013 JournalChineseMass SpectrometrySociety 基质辅助激光解吸电离一串联飞行时间质谱鉴定鲨鱼硒结合蛋白 王 勇1，李水明1，何曼文2 (1．深圳大学生命科学学院，深圳市海洋生物资源与生态环境重点实验室，广东深圳518060 2．深圳大学生命科学学院，深圳市微生物基因工程重点实验室，广东深圳 518060) 摘要：利用基质辅助激光解吸电离一串联飞行时间质谱(MALDI-TOF／TOF)高置信度地鉴定了原核表达的 白鳍鲨硒结合蛋白。实验表明，硒结合蛋白肽段之一被错误指认为胰酶自水解峰和混合谱是影响其未进行 串联质谱分析或不能被数据库搜索匹配的主要原因，同时还发现，虽然赖氨酸结尾肽段在MALDI源中信号 强度普遍很低，但对它们进行串联质谱分析也可获得较好的谱图质量，部分数据可用于从头测序。考虑以 上因素后，硒结合蛋白鉴定覆盖率由35％增至51％。 关键词：硒结合蛋白；基质辅助激光解吸电离一串联飞行时间质谱(MALDl一TOF／TOF)；蛋白质鉴定；数据库 搜索；手工解析 中图分类号：O657．63文献标志码：A 文章编号：1004—2997(2013)05一0257～06 doi：10．7538／zpxb．2013．34．05．0257 Identificationof ProteinofShark Selenium—Binding Mass MALDI—ToF／ToF by Spectrometry WANG Man—wen2 Yon91，LI Shui—min91，HE (1． BiorPso“rcPsn行d SfiP行cP， S^已行z矗P竹K已yLn60rnforyo。厂Mnri行P EcoZog_)I，CoZZPgPo，Li／0 51 S^已九z^已咒U行iuersi￡y，S矗已行z矗P，28060，(冼in以； 2．S^P竹z，le行K已yLn60rnforyD厂^彳掂r06inZ Ge刀Pf站E行gin已Pri雄g，CoZZPgeo，L屯陀Scie，zfP， S^已挖2^P以L7hiu已rsify，S^e咒z^P以518060，C^i玎n) Abstract：Prokaryoticexpressed reefsharkwas selenium～bindingprotein(SBP)ofwhitetip identifiedmatrix—assistedlaser tandem mass by desorption／ionization time—of—flightspec— conf