核酸-2.ppt

第五章???核 酸;一、DNA的结构;DNA的一级结构;DNA的一级结构;DNA的一级结构;核酸长链书写;Judson (1996) The Eighth Day of Creation;①、两条反平行的多核苷酸链绕同一中心轴相缠绕，形成右手双股螺旋，一条5’→3’，另一条3’→5’;②、磷酸与脱氧核糖彼此通过3’、5’-磷酸二酯键相连接，构成DNA分子的骨架。;④、两条核苷酸链之间依靠碱基间的氢链结合在一起， A与T相配以，形成2个氢键；G与C相配对，形成3个氢键。;⑥、碱基平面与纵轴垂直，糖环平面与纵轴平行;⑦、每圈螺旋有10个核苷酸 ，碱基堆积距离0.34nm，双螺旋平均直径2nm， ⑧、大沟：宽1.2nm ，深0.85nm， ⑨、小沟 ：宽0.6nm，深0.75nm;⑩、碱基在一条链上的排列顺序不受任何限制。当一条多核苷酸链的序列被确定后，互补链的序列确定。这表明，遗传信息由碱基的序列所携带。; DNA结构双螺旋结构的提出，被认为是本世纪生命科学史最重要的贡献之一，同时也是自然科学史上的重大贡献。它直接解释了生物遗传信息的传递与表达的规律，使生命科学从此进入一个崭新的时代即分子生物学时代。;2、稳定双螺旋结构的因素 ①碱基堆积力形成疏水环境（主要因素） 。 ②碱基配对的氢键。GC含量越多，越稳定。 ③磷酸基上的负电荷与介质中的阳离子或组蛋白的正离子之间形成离子键，中和了磷酸基上的负电荷间的斥力，有助于DNA稳定。; 核酸骨架的自由度比蛋白质高 ;3、? DNA二级结构的多型性 P489 ;4、三股螺旋DNA K. Hoogsteen 1963;第一股是寡嘧啶，中间是寡嘌呤，第三股可以是寡嘧啶或寡嘌呤;T= A : A , C≡G ： C+ T = A : T C≡G ： G;DNA三股螺旋结构常出现在DNA复制、转录、重组的起始位点或调节位点，如启动子区。 第三股链的存在可能使一些调控蛋白或RNA聚合酶等难以与该区段结合，从而阻遏有关遗传信息的表达。;四股DNA;DNA的三级结构是指DNA分子在双螺旋的基础上通过扭曲和折叠形成的特定构象。 包括不同二级结构单元间的相互作用、单链与二级结构单元间的相互作用以及DNA的拓扑特征。 超螺旋是DNA三级结构的主要形式。;1、环状DNA的三种典型构象 P491;三种环状DNA分子具有相同的结构，但是拓扑构象不同，称它们为拓扑异构体。;①连环数（linking number , L） DNA双螺旋中，一条链以右手螺旋绕另一条链缠绕的次数 ②扭转数（twisting number , T） DNA分子中的Watson-Crick螺旋数目，以T表示 ③超螺旋数（缠绕数 , writhing number , W） ④比连环差（λ）表示DNA的超螺旋程度;3、拓扑异构酶 改变DNA拓扑异构体的L值。 ①拓扑异构酶酶I（解旋酶） 能使双链负超螺旋DNA转变成松驰形环状DNA，每次催化使L值增加1。 ②拓扑异构酶酶II（促旋酶） 能使松驰环状DNA转变成负超螺旋形DNA，每次催化使L减少2。;基因组DNA与蛋白质结合形成染色体（染色质） （1）整个病毒可以看成游离的染色体 组成：核酸、蛋白、脂类、糖类 基因组：单链或双链的DNA（或RNA），多数环状 形状：丝状、多面体状、 （2）细菌染色体的结构——拟核，nucleoid 细菌基因组多数为双链环状DNA ，与碱性蛋白、RNA结合，形成带有无数突环的刷状染色体。p494;（3）真核生物染色体的结构;（3）真核生物染色体的结构;（3）真核生物染色体的结构;（3）真核生物染色体的结构; 染色体的结构层次 ;DNA一级结构的不均一性 1.重复序列 1)高度重复序列 2-10bp/copy, 105-106 copies/genome 多为串联重复排列 分布于着丝点、端粒区、结构基因两侧 2)中度重复序列 0.1-1Kb/copy 10-104 copies/genome 多为间隔重复 rDNA\tDNA\Histone gene cluster 3)单拷贝序列（single copy sequence);真核生物DNA的序列特点;真核生物DNA的序列特点;3）镜象结构 ;真核细胞的内含子（Intron）与 外显子（Exon）;Intron的发现;第三节 核酸的结构;（二）RNA的一级结构 P483 ①AMP、GMP、CMP、UMP通过3’、5’磷酸二 酯键形成的线形多聚体。 ② 组成RNA的戊糖是核糖。 ③?天然RNA分子都是单链线形分子，只有部分