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遗传学2.3.ppt
第三节 遗传学数据的统计处理 (问题的提出) 一、概率原理与应用(概率和遗传比例的计算) 二、二项式展开与应用 三、?2测验(Chi平方测验)与应用(适合度测验、 用卡平方来测定适合度) 为什么要应用统计方法分析数据? 孟德尔对数据的处理: 归类统计(归类记载)与描述统计。 实际结果与理论比例波动的解释: 孟德尔杂交试验结果与理论比例的差异; 遗传学者发现,当时的概率论和统计学上的方法,已经能够解决那些机遇性的波动问题了。 一、概率原理与应用 (一) 概率(probability): 概率(机率/几率/或然率):指在反复试验中,预期某一事件的出现次数的比例。 用P(A)表示事件A发生的概率。 例:杂种F1产生的配子中,带有显性基因和隐性基因的概率均为50%。 遗传研究中可通过概率来推算遗传比率,从而分析和判断该比率发生的真实性和可靠性。 (二)概率基本定理(乘法定理与加法定理) 1. 乘法定理:两个(或两个以上)独立事件同时出现的概率等于它们各自概率的乘积。 如两个独立事件(事件A的发生并不影响事件B的发生)同时发生的概率P(AB)=P(A)×P(B) 例:双杂合体(YyRr)中,Yy的分离与Rr的分离是相互独立的,在F1的配子中: 具有Y的概率是1/2,y的概率是1/2; 具有R的概率是1/2,r的概率是1/2。 而同时具有Y和R的概率是两个独立事件(具有Y和R)概率的乘积:1/2×1/2=1/4。 2. 加法定理:两个互斥事件同时发生的概率是各个事件各自发生的概率之和。 P(A+B)=P(A)+P(B) 互斥事件——在一次试验中,某一事件出现,另一事件即被排斥;也就是互相排斥的事件。如:抛硬币。 举例:豌豆子叶不是黄色,就是绿色,二者只居其一。如果问子叶黄色和绿色的概率是多少?则是二者概率之和,即1/2+1/2=1。 又如:杂种F1(Cc)自交,F2基因型为CC与Cc是互斥事件,两者的概率分别为1/4和2/4,因此F2表现为显性性状(开红花)的概率为两者概率之和——基因型为CC或Cc。 (三) 概率定理的应用 1. 用乘法定理推算F2表现型种类与比例 如前所述,根据分离规律,F1(YyRr)自交得到的F2代中: 子叶色呈黄色的概率为3/4,绿色的概率为1/4; 种子形态圆粒的概率为3/4,皱粒的概率为1/4。 因此根据乘法定理: 2.按棋盘方法推算F2基因型种类与比例 3.用分枝法来推算F2表现型种类与比例 分枝法: 由于各对基因的分离是独立的,所以可以依次分析各对基因/相对性状的分离类型与比例(概率)。 如果亲代的每一性状的基因型已经知道,而且每对基因与另一对基因都是自由组合的,那么预期子代的基因型和表型比数可用分枝法来推算。 二、二项式展开与应用 我们可以通过棋盘格法或分枝法把显性和隐性基因数目不同的组合及其概率进行整理排列,并获得比例数值。 但很多遗传学问题不单是有关某一事件出现的概率,有时也牵扯到某种事件组合出现的概率。 掷两次硬币,出现的情况: 两次均为字面,1/4; 一次为字面,一次为画面,1/2; 两次均为画面,1/4; 比值为1:2:1,组合系数符合二项式展开的系数(p+q)2=p2+2pq+q2。 (一)二项式公式与通式 设p = 某一事件出现的概率, q = 另一事件出现的概率,p + q = 1。 n = 估测其出现概率的事件数。 这一事件的每一组合的概率,就可用二项式展开来说明。 二项式展开的公式为: 一对夫妇想生10个孩子,其中5男5女的概率是多少? (二) 二项式展开式的应用(含通式) 1、计算杂种后代F2群体中不同个数显隐性基因型比例 2、用于测交后代Ft群体中表现型的排列和分析 3、用于推算杂种自交后代F2群体中不同表现型个体出现的频率 (二) 二项式展开式的应用(含通式) 1、计算杂种后代不同个数显隐性基因型比例 根据孟德尔的定律,任何一对完全显隐性的杂合基因型,其自交的F2群体中, 显性基因出现的概率: p=(1/2), 隐性基因出现概率:q=(1/2), p+q=(1/2)+(1/2)=1。 n 代表杂合基因个数,则其二项式展开为: 如果只需了解3显性和1隐性基因个体出现的概率,即n=4,r=3,n-r=4-3=1;则可采用单项事件概率的通式进行推算,获得同样结果。 如果只需了解3显性和3隐性基因个体出现的概率,即n=6,r=3,n-r=6-3=3;则可采用单项事件概率的通式进行推算,获得同样结果。 三、 ?2测验(Chi-square test) 在遗传学试验中,由于种种因素的干扰,实际获得的各项数值与其理论上按概率估算的期望数值常具有一定的偏差。一般说来,如果对实验条件严加控制,而且群
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