人类基因组及基因组学概论92207课件.pptVIP

授课计划 45个学时，分12次授课。 第三周至第十六周，周六6:30pm开始。 注意：第四周及第五周因学校规定不授课。下一次课放在10月13日（周六），请互相转告！！！ 课程简介 教材: 《基因组学》第二版（杨金水 著,北京，高等教育出版社，2007年） 考核方式：平时作业及课堂表现占50%；综述或实验设计占50% 。 课程内容 第一章 基因组与基因组学 第二章 基因组作图 第三章 基因组测序 第四章 基因组序列组装 第五章 基因组解剖 第六章 基因组序列注释 第七章 基因组学的发展与应用 第一章 基因组与基因组学 一、基因组学概况 二、人类基因组计划 三、遗传的分子基础 四、基因组序列复杂性 五、基因与基因家族 六、人类基因组 一、基因组学概况 （一）基因组学基本概念 （二）基因组学分支 （三）基因组学的意义 基因组（genome） 基因组（genome）一词系由德国汉堡大学H. Winkles 教授于1920年首创，从GENe和chromosOME组成。用于表示生物的全部基因和染色体组成的概念。 基因组（genome）：生物所具有的携带 遗传信息的遗传物质的总和。 真核生物基因组 核基因组 线粒体基因组 叶绿体基因组 原核生物基因组 染色体 质粒 基因组学（genomics） 由美国科学家Thomas Roderick于1986年首创。 基因组学（genomics）：涉及基因组作图、测序和整个基因组功能分析的一门学科。 基因组学发展史 1980年，噬菌体（5,368 碱基对）完全测序，成为第一个测定的基因组。 1990年，人类基因组计划开始实施。 2000年，人类基因组草图完成。 2003年，人类基因组计划完成。 目前，已完成基因组测序的模式生物包括小鼠，果蝇，酵母等。 基因组学发展趋势 基因转录及其调控的研究 解析控制整个发育过程或反应通路的基因表达网络。 蛋白质组学研究 从整体上研究蛋白质的水平和修饰状态。 研究蛋白质之间的相互关系。 基因组多样性的研究 对人类DNA的再测序 对其它生物的测序 结构基因组学 结构基因组学： 通过基因组作图、核苷酸 序列分析确定基因组成、 基因定位的科学。 基因组测序 目前DNA测序每次反应仅能读取不到 1000bp的长度。已知最小的细菌基因组 为580000bp。人类基因组为30多亿bp。 因此，首先将整个基因组的DNA分解为 一 些小片段，然后将这些分散的小片段 逐个测序，最后将测序的小片段按序列组 装。 基因组作图 在长链DNA分子的不同位置寻找特征性的分子标记，绘制基因组图。 根据分子标记可以准确无误地将已测序的DNA小片段锚定到染色体的位置上。 功能基因组学 功能基因组学： 利用结构基因组学 提供的信息和产 物，在基因组系统 水平上全面分析基 因功能的科学。 比较基因组学 比较基因组学：研究不同物种之间在基因组结构和功能方面的亲源关系及其内在联系的学科。 比较基因组学的研究内容 通过研究不同生物基因组结构和功能上的相似之处，不仅能勾画出一张详尽的系统进化树，而且将显示进化过程中最主要的变化所发生的时间及特点。据此可以追踪物种的起源和分支路径。 了解同源基因的功能。 对序列差异性的研究有助于认识产生大自然生物多样性的基础。 （三）基因组学的意义 生物学研究 例如：人类疾病基因研究 医学 生物技术 制药工业 社会经济 生物进化 伦理，法律及社会 人类疾病基因研究 疾病的遗传学基础。 致病基因及相关基因的克隆在基因组学研究中占据着核心位置。 对疾病的预防，诊断，治疗等有重要意义。 人类基因组计划的直接动因是要解决包括肿瘤在内的人类疾病的遗传学基础问题。 人类疾病基因研究 单基因病疾病基因研究 例如血友病。 多基因病疾病基因研究 例如心脏病，糖尿病，癌症等。 单基因病疾病基因研究 人类基因组计划使我们了解基因组序列。 现在采用定位候选克隆方法 极大地提高了发现疾病基因的效率。 定位候选克隆 通过遗传分析等方法将疾病基因定位到染色体区段上。 对人类基因组图上该区段内的基因进行功能分析，并筛选出疾病基因 定位候选克隆 单基因病疾病基因克隆 导致了亨廷顿舞蹈病、遗传性结肠癌和乳腺癌等一大批单基因遗传病致病基因的发现，为这些疾病的基因诊断和基因治疗奠定了基础。