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生化课件第二十一章 DNA重组及重组DNA技术知识.ppt
DNA重组和重组DNA技术
DNA Recombination and Recombinant DNA technology;起初上帝创造天地,
地是空虚混沌,渊面黑暗,
上帝的灵运行在水面上,
上帝说:“要有光,就有了光。”
------《旧约全书·创世纪》;第 二 节 重组DNA技术;本节主要内容;重组DNA技术
应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质DNA与载体DNA接合成一具有自我复制能力的重组DNA分子——复制子(replicon),继而通过转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增提取获得大量同一DNA分子,也称分子克隆或重组DNA 技术 。
;酶切后的目的基因片段;;;;基因克隆的基本步骤; 限制性核酸内切酶
连接酶
聚合酶(Taq酶、末
端转移酶)
多聚核苷酸激酶
碱性磷酸酶;1. 限制性核酸内切酶
(restriction endonuclease, RE);第一个字母取自产生该酶的细菌属名,用大写;
第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写;
第四个字母代表株;
用罗马数字表示发现的先后次序。;Ⅱ类酶识别序列特点—— 回文结构(palindrome) ;在对称轴中心同时切割双链,产生平末端或称钝性末端(blunt end),如Hpa I:; 在对称轴两侧相对位点分别切割一条链。从 5端切割产生5 端突出的粘性末端,如EcoR Ⅰ :;限制性内切酶作用过程; 1.在下述双链DNA序列(仅列出其中一链序列)中不属于完全回文结构的是
A.AGAATTCT
B. TGAATTCA
C.GGAATTCC
D.CGTTAAGC
E.AGATATCT;常用的载体按来源分为:
质粒(plasmid)、噬菌体(phage)和病毒(virus);载体的选择标准;质粒(plasmid);;λ噬菌体 λ噬菌体是大肠杆菌的噬菌体,它由外壳蛋白和λ-DNA组成 。λ噬菌体(lambda bacteriophage)DNA,为线性双链DNA,它的两端各有12个碱基的互补粘性末端,称COS位点。当噬菌体侵入宿主细胞,两个粘性末端互补结合,形成环状分子。λDNA在体外可包装成病毒颗粒,并高效感染大肠杆菌。
;lacZ’基因: 编码?-半乳
糖苷酶的?-片段;酵母人工染色体
(yeast artificial chromosome, YAC)
细菌人工染色体
(bacterial artificial chromosome, BAC)
动物病毒DNA改造的载体
(如腺病毒,腺病毒相关病毒,逆转录病毒);三、重组DNA技术基本原理及操作步骤; 以
质
粒
为
载
体
的
DNA
克
隆
过
程;(一)目的基因的获取;* 化学合成法获取目的基因;组织或细胞染色体DNA;mRNA ;cDNA文库的特点
◆代表了取材当时所表达基因的总和,不包括那些未表达的基因。
◆mRNA分子中不包括内含子及调控序列,所以cDNA文库的复杂性要比基因组文库低的多。
;体外高效、快速、特异地扩增目的基因或DNA片段的技术。
其原理类似于DNA的体内复制,只是在试管中给DNA的体外合成提供一种合适条件——模板DNA,寡核苷酸引物, dNTPs ,DNA聚合酶,合适的缓冲液系统(Mg2+)和DNA变性、复性(退火)及延伸的温度与时间等,使目的DNA得以迅速扩增 .;5?;Cycle 3;DNA片段;(三)外源基因与载体的连接;粘性末端连接;DNA连接酶的作用过程;Bam HⅠ切割反应;不同限制酶切位点(非配伍末端)的连接;2. 平端连接
适用于:限制性内切酶切割产生的平末端的补齐;3. 同聚物加尾连接
在末端转移酶(terminal transferase)的作用下,在DNA片段末端加上同聚物序列、制造出粘性末端,再进行粘端连接。
如将poly(dA)加到双链DNA片段3’ 羟基上,而将poly(dT)加到质粒载体3’ 羟基上,制造出粘性末端,然后通过退火进行粘性末端连接。
;受体菌条件 安全宿主菌
限制酶和重组酶缺陷
处于感受态(competent) ;;连接;1)抗药性标志的选择(插入失活法);2)标志补救(?-半乳糖苷酶法);;;; 指用探针检测样品中未知核酸序列,通过碱基互补配对原则发生同源性结合,再经显影或显色的方法,将结合的核酸序列的位置或大小显示出来。;菌落原位杂
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