利用微卫星标记定位家兔生长和被毛性状基因座位的分析-analysis of locating gene loci of rabbit growth and coat traits by microsatellite markers.docxVIP

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2018-05-29 发布于上海
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利用微卫星标记定位家兔生长和被毛性状基因座位的分析-analysis of locating gene loci of rabbit growth and coat traits by microsatellite markers.docx

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利用微卫星标记定位家兔生长和被毛性状基因座位的分析-analysis of locating gene loci of rabbit growth and coat traits by microsatellite markers

摘要进行家兔重要经济性状的 QTL 定位对于基因的位置克隆研究以及家兔的遗传改良具有重要意义。本研究采用微卫星标记对家兔基因组进行了扫描，对家兔生长和被毛性状的 QTL 研究结果如下。采用 9 只肉兔和 24 只獭兔建立了 F2 和回交资源家系，共获得后代 433 只，其中 F2 后代 206 只，BC 后代 220 只，分别测量了 60 日龄体重、90 日龄体重、120 日龄体重、90 日龄体长、90 日龄胸围、90 日龄臀围、90 日龄毛长、120 日龄体长、120 日龄胸围、120 日龄臀围、120 日龄毛长、60-90 日龄平均日增重和 90-120 日龄平均日增重共计 13 个数量性状和被毛表型 1 个质量性状。以等位基因数多，多态性丰富为原则，从 1、2 和 15 号染色体共计 29 个微卫星标记中筛选出多态性丰富的 10 个微卫星标记，其平均杂合度 H（Hu.）为 0.5344946，平均多态信息含量 PIC 为 0在回归分析原理的基础上，采用爱丁堡大学的在线分析软件 QTL Express 对 1、2 和 15 号染色体进行 QTL 定位分析。结果显示在 2 号染色体相对与标记 INRACCDDV0192 的 18cM 处，发现一个潜在的影响 90 日龄体重的 QTL，LOD 值为 4.146；13cM 处发现一个潜在的影响 120 日龄体重的 QTL，LOD 值为 3.689；16cM 处发现一个潜在的影响 120 日龄臀围的 QTL，LOD 值为 3.522；35cM 处发现一个潜在的影响 60-90 日龄平均日增重的 QTL，LOD 值为 3.59，其余各性状在各条染色体上的 LOD 值都小于 3。其中 90 日龄体重、120 日龄体重、120 日龄臀围和 60-90 日龄平均日增重在 2 号染色体上都有较高的加性效应，相应的 F 检验都呈现出极显著水平。另有 90 日龄体重在 1 号染色体、 90 日龄臀围在 2 号染色体、90 日龄毛长在 1 号染色体、120 日龄体长在 2 号染色体、120 日龄毛长在 2 号染色体、90-120 日龄平均日增重在 1 号染色体相对的 F 检验都呈现出极显著水平，相应的 LOD 值分别是 2.66、2.846、2.589、2.632、2.72 和 2.48。被毛表型在各染色体 LOD 值都小于 3，F 值都未超过显著水平。关键词：兔；区间定位；生长性状；微卫星标记AbstractThe QTL mapping for important economic traits in rabbit has contribution of positional cloning and rabbit breeding. We screened the rabbit genome with microsatellite markers, and performed QTL mapping on growth and Coat traits in rabbits. F2 and backcross design were used to create resource families with meat rabbit and rex rabbit. A referenc population of 433 rabbits comprising eighty-four three-generation families with 1-10 offspring per family was produced. 14 traits were measured including 13 quantitative traits that were body weight at 60 d (BW60), body weight at 90 d (BW90), body weight at 120 d (BW120), body length at 90 d, chest measurement at 90 d, hip measurement at 90 d, wool length at 90 d, body length at 120 d, chest measurement at 120 d, hip measurement at 120 d, wool length at 120 d, average daily gain from 60 d to 90 d and average daily gain from 90 d to 120 d respectively, and one qualitative trait that