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有机化合物的弱相互作用及定量构造-活性相关(QSAR)研究
摘 要
近年来,弱相互作用的研究受到了广泛的重视,其中二级化学键(Secondary
chemicalbonds)是新发现的一种非相邻原子间的具有某些化学键性质的弱相互作
用。本论文以金属有机汞化合物为研究体系,应用分子图形学、分子力学 MMX
和半经验量子化学方法对二级化学键进行了研究,从能量和稳定构象的角度进行
计算和比较,证明了在这类金属有机化合物中存在着二级化学键,并且二级化学
键对分子的结构有重要的影响。
随着近代结构化学和计算化学理论、方法和工具的丰富以及计算机技术的迅
猛发展,使得合理药物分子设计有了巨大的发展。在2D-QSAR研究中,人工神经
网络方法被证明是较为有效的方法之一。本论文编写了人工神经网络中的误差反
传((BP)模型的程序,并且提出了批处理算法和改变学习速率的方法以加快收敛。
针对人工神经网络中的过拟合问题,在三个方面进行了研究:(1)对网络输入变量
进行筛选,提出了两种方法,即将人工神经网络的输入与多元线性回归分析相结
合;将人L_神经网络同主成分分析相结合。(2)网络合理结构的建立,确定隐含层
节点数。(3)交叉验证法训练网络。通过对单环芳香化合物的结构与生物降解性的
定量关系、神经网络预测含硫芳香族化合物的水解速率常数、磺酞脉类除草剂的
结构与活性相关三个体系的计算,得到了合理而可靠的预报结果,验证了以上方
法是非常有效的。
丫 、/
关键词:弱相互作用,二级化学键,定量构效关系,人工神经网络,主成分分析,
误差反藻法,变颤哒
ABSTRACT
Theresearchofweakinteractionshasbeenwidelystudiedinrecentyears.
Secondarychemicalbondisakindofweakinteractionoccurringbetweenatoms,which
arenotlinkedbynormalchemicalbonds,buthassomecharacteristicsofchemicalbonds.
Usingmoderntheoryofchemicalbondaswellasthecalculatingmethodsofcomputer
moleculargraphics(PCMODEL),molecularmechanicsMMXandsemi-empirical
quantum chemistry (AM1,PM3),secondary chemicalbond,which existsin
organomercurycompounds,wasstudied.Fromcalculatingandcomparingwiththe
energyandstableconformationsofdifferentmolecularpairs,itwasconcludedthat
secondarychemicalbondsareformedandhaveanimportanteffectonthestructuresof
thesecompounds.
Withtheaccumulationoftheories,methodsandtoolsofmodernstructuralchemistry
andcomputationalchemistry,itisgreatdevelopedonreasonabledrugdesign.ANN
(ArtificialNeuralNetwork)isprovedtobeanefficienttoolin2D-QSAR(Quantitative
Structure-ActivityRelationship)study.Inthisthesis,programonBP(Back-Propagation)
modelwasdesigned.Theconvergencespeedcanbeincreasedwithnewcontrolscheme
oflearningstepandbatchprogramalgorithm.Inordertoavoidtheoverfittingproblem,
threeaspectsarestudied:
I VariableselectioninANNbycombiningANNwith
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