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生物化学 第10章 酶作用机制和酶调节
Chapter10 酶的作用机制和酶的调节 二、影响酶催化效率的有关因素 底物和酶的邻近效应与定向效应 底物的形变和诱导契合 酸碱催化 共价催化 金属离子催化 多元催化和协同效应 活性部位微环境的影响 (一)底物和酶的邻近效应与定向效应 邻近效应:在酶促反应中,由于酶和底物分子之间的亲和性,底物分子向酶的活性中心靠近,最终结合到酶的活性中心,使底物在酶活性中心的有效浓度大大增加的效应。 定向效应:当专一性底物向酶活性中心靠近时,会诱导酶分子构象发生改变,使酶活性中心的相关基团和底物的反应基团正确定向排列,同时使反应基团之间的分子轨道以正确方向严格定位,使酶促反应易于进行。 (二)底物的形变和诱导契合 底物敏感键扭曲变形,底物与酶结合以后,其电子云要发生重排,产生电子张力,使敏感键更加敏感,更易反应 (三)酸碱酸化 在酶促反应中,酶分子的某些功能基团可作为酸或碱通过瞬间向底物提供质子或从底物分子抽取质子,相互作用而形成过渡复合物,使活化能降低,加速反应进行,称作酸碱催化(acid-base ratalysis)。 (四)共价催化 催化剂通过与底物形成反应活性很高的共价过渡产物,使反应活化能降低,从而提高反应速度的过程,称为共价催化。 (三) 酶的共价修饰 共价修饰(covalent modification) 在其他酶的催化作用下,某些酶蛋白肽链上的一些基团可与某种化学基团发生可逆的共价结合,从而改变酶的活性,此过程称为共价修饰。 1. 了解影响酶催化效率的有关因素 2. 掌握别构酶、同工酶的概念 3. 了解酶工程的含义及酶的应用 H H H H H H H M H H M M H M M M M M M M LDH1 (H4) LDH2 (H3M) LDH3 (H2M2) LDH4 (HM3) LDH5 (M4) 乳酸脱氢酶的同工酶 * 举例:乳酸脱氢酶(LDH1~ LDH5) 乳酸脱氢酶的电泳行为 HHHH (LDH1) HHHM (LDH2) HHMM (LDH3) HMMM (LDH4) MMMM (LDH5) 同工酶存在于同一种属的不同个体,同一个体的不同组织、同一细胞的不同亚细胞结构,以及同一组织、细胞的不同发育阶段。 5 56 0 12 0 79 5.7 0 0 LDH5 (M4) 20 27 1 5 0 16 11.7 6 1 LDH4 (HM3) 10 11 12 35 3 5 20.9 33 12 LDH3(H2M2) 25 4 44 34 24 0 34.7 49 44 LDH2 (H3M) 10 2 43 14 73 0 27.1 12 43 LDH1 (H4) 脾 肝 肾 肺 心肌 骨骼肌 血清 白细胞 红细胞 LDH同工酶 人体各组织器官LDH同工酶谱(活性%) 在代谢调节上起着重要的作用; 用于解释发育过程中阶段特有的代谢特征; 同工酶谱的改变有助于对疾病的诊断; 同工酶可以作为遗传标志,用于遗传分析研究。 心肌梗死和肝病病人血清LDH同工酶谱的变化 1 酶活性 心肌梗死酶谱 正常酶谱 肝病酶谱 2 3 4 5 本章考点 * * * * * * * * (一)酶活性部位的特点 在酶蛋白中只有少数特异的氨基酸残基参与底物结合及催化作用,这些特异的氨基酸残基比较集中的区域,即与酶活力直接相关的区域称为酶的活性部位或活性中心(通常将酶的结合部位和催化部位总称为酶的活性部位或活性中心)。 (二)研究酶活性部位(活性中心)的方法 1、侧链基团化学修饰 2、动力学参数测定法 3、X射线晶体结构分析法 一、酶的活性部位 E E S —COOˉ —NH2 —S ˉ —COOH —NH3+ —SH 广义碱性基团(质子受体) 广义酸性基团(质子供体) 狭义酸碱:酸 —— H+ 碱 —— OH- 广义酸碱:酸 — 能释放质子的化合物 碱 — 能接受质子的化合物 His是酶的酸碱催化作用中最活泼的一个催化功能团 酶分子上的共价催化基团分为亲核基团和亲电基团。 亲核基团有组氨酸的咪唑基、半胱氨酸的硫氢基、丝氨酸的羟基,另外还有一些辅助因子, 如TPP、CoA等 (五) 金属离子催化 – 屏蔽负电荷 促进水的离子化 (六)多元催化和协同效应 多元催化:同时具有几种效应的催化机理 协同效应:多种效应互相配合而起作用的催化机理 如核糖核酸酶 酸催化 碱催化 + — 水环境 + — 疏水环境 (七) 疏水微环境 酶活性中心为疏水环境 特点:电荷之间的作用力远远大于亲水环境,大大加强了酶的催化基团与底物分子间的作用力, 结果:有利于降低反应活化能。 三、别构酶与别构调
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