【生物课件】X-ray与结构生物.ppt

X-ray與結構生物 B9302067　范馨月 B9302071　張士純 B9302078　陳芳婷 B9302090　萬智杏 B9302096　盧聖芸 B9302101　黃怡婷 摘要 何謂結構生物學 X-ray繞射原理 從X-ray繞射圖到DNA結構 利用X-ray研究蛋白質的3-D結構 蛋白質結構的重要性 發展與應用 X-Ray與結構生物學 結構生物學（Structural Biology） 　- 測定大量的蛋白質三維結構 　- 應用：功能預測 X-ray：波長約1 ? ?長度接近原子間的距離 ?研究結晶的狀態的分子行為 ?定出其晶體結構，也包含蛋白質體結構 X-ray與結構生物學 ? 利用X-ray繞射法分析高度純化結晶的蛋白質　　 　　　的每個基團和原子的空間定位。 X-ray繞射原理 B9302090　萬智杏 大綱 晶格特性 –Characters 真晶格　 –Translational Vector 倒晶格 –Reciprocal Lattice Vector 影像 –Image 數學工具 –傅立葉轉換 布拉格定理–Bragg’s Law Characters 晶體堆積模式 重複性(週期性) 原子 電子雲 Translational Vector 真晶格 實際堆積的情形 Reciprocal Lattice Vector 倒晶格 藏在投影影像中 Image 影像 =/= 倒晶格 影像經過數學運算後得到倒晶格與真晶格 Trans V.S Image 圖像和真倒晶格的關係 順序：圖 ? 倒 ? 真 結構因子 來自傅立葉分析 數學部份 ? 忽略 Fourier Analysis Q1: 什麼是傅立葉分析?? Q2: 傅立葉分析的應用?? Q3: 為什麼傅立葉分析適用晶格轉換?? Fourier Analysis A1 傅立葉分析是一種疉加的概念(蓋房子) 傅立葉級數式: 尤拉公式 eiφ = cosφ + isinφ 其概念與極式相通 Fourier Analysis A1 Fourier Analysis A2 方波的形成 (使用奇數倍頻率正弦波疊加) 再造聲波 – 電子琴 Fourier Analysis A3 T 真晶格 G 倒晶格 電子雲密度為週期函數 Fourier Analysis A3 結論 電子雲的週期性造就 真晶格(T) 倒晶格(G) 的互換關係 真晶格和倒晶格的空間向量內積 傅立葉分析結論 適用於所有具有週期性的函數 拆解複雜的週期函數 房子的設計圖概念 傅立葉分析是圖像，倒晶格，真晶格的橋樑 Bragg’s Law 從X-ray到DNA--解開DNA雙螺旋結構之謎 B9302071　張士純 B9302078　陳芳婷 雙螺旋結構的發現 利用X-ray研究蛋白質的3-D結構 B9302067　范馨月 B9302078　陳芳婷 X-ray研究蛋白質的3-D結構 測量方法 Laue method Rotating-crystal method Powder method Laue method Rotating-crystal method Powder method 原理與Rotating-crystal 相似 結晶為粉末狀 布拉格繞射圖 X射線結晶學揭露第一個蛋白質結構——myoglobin實驗 大分子三度空間結構 1950年代前——維生素B12 1957年,John Kendrew——肌紅蛋白 hjhkkkkkkkkkkk (myoglobin 17.8kdal) 蛋白小 容易製備與結晶 肌紅蛋白結晶化 X-ray crystallography實驗組成裝置 肌紅蛋白結晶X-ray分析圖 肌紅蛋白電子密度圖(部分) 低解析度肌紅蛋白模型 高解析度下的肌紅蛋白模型 蛋白質結構的重要性X-ray與結構生物學的近來發展 B9302101　黃怡婷 蛋白質3D結構重要性 20種胺基酸組成 在立體空間上摺疊，產生複雜的螺旋、蓆狀、和彎曲 特有的活性功能區域 生物機制和功能 基礎生命科學領域 驗證生化反應機制及實驗假說 提供新的詮譯與研究方向  協助搜尋並快速決定小分子藥物的構造 降低新藥開發所需的時間與投資成本 改進藥物的療效 愛滋病毒抑制藥物 X-光晶體繞射學之近來改變與發展 同步輻射光源的應用 結構基因體學的發展 同步輻射光源(synchrotron radiation ) 光源強大、品質穩定 光源能量可調整 MAD+先進的電荷耦合器+同步輻射的強大光源 巨大分子的晶體---晶格