生物化学——蛋白质化学PPT.ppt

第一章 蛋白质化学;;;第一节 蛋白质概述;一、蛋白质的概念;三、蛋白质的基本组成单位;四、蛋白质的分类;五、蛋白质在生命活动中的重要功能 ;3）防御功能：抗体、溶菌酶、（肠道等分泌的）粘蛋白等 4）信息传递功能：起接受和传递信息作用的受体蛋白等 5）调节和调控功能：激素、调节因子 3、储存和营养功能 蛋中的卵清蛋白、乳中的酪蛋白、小麦种子中的麦醇溶蛋白等 4、氧化供能 ;第二节 氨基酸的结构、分类和性质;;二、20种普通氨基酸（common amino acids）的结构 ;非极性中性--脂肪族R基团;甘氨酸，Gly(G) 唯一无手性碳原子的氨基酸 无镜象立体异构体 直接和四个不相同的原子或原子团相连的碳原子 ;;;;;;;芳香族R基团氨基酸;芳香族R基团氨基酸;芳香族R基团氨基酸;芳香族R基团氨基酸;极性中性R基团;极性中性R基团;;;极性非带电R基团;极性非带电R基团;碱性氨基酸(带正电R基团);赖氨酸，Lysine，Lys（K) 侧链连接一个氨基，为碱性 氨基酸 EAA;精氨酸，Arg（R) 含胍基， 碱性氨基酸 ;组氨酸，His（H) 含咪唑基， 碱性氨基酸 EAA ;酸性氨基酸-带负电R基团;二）R侧链的特殊性及其作用;5）两Cys残基的巯基可以形成二硫键：对形成和稳定Protein的特定结构起着重要的作用。;;三、氨基酸的种类;;;N-甲酰蛋氨酸（N-Formylmethionine ，fMet);selenocysteine and pyrrolysine, are incorporated into proteins by unique synthetic mechanisms. Selenocysteine is incorporated when the mRNA being translated includes a SECIS element, which causes the UGA codon to encode selenocysteine instead of a stop codon. Pyrrolysine is used by some methanogenic archaea in enzymes that they use to produce methane. It is coded for with the codon UAG, which is normally a stop codon in other organisms. This UAG codon is followed by a PYLIS downstream sequence. N-Formylmethionine (fMet) is a proteinogenic amino acid. It is a derivative of the amino acid methionine in which a formyl group has been added to the amino group;;胶原蛋白中;胶原蛋白中;肌球蛋白;凝血酶原;;四、氨基酸的理化性质;（一）两性解离和等电点;兼性离子形式;;酸性氨基酸的pI;;;3、氨基酸在不同pH溶液中的带电情况 溶液pHpI,氨基酸带正电荷，在电泳时向负极运动。 pH=pI，氨基酸所带总电荷为零??在电泳时不移动。 pHpI,氨基酸带负电荷，在电泳时向正极运动。 ;（二）其他理化性质;;4.茚三酮反应;第三节 蛋白质的结构;一 、肽键和肽链;（一）肽键;2.肽键的刚性：肽键具有部分双键性质 酰胺氮（含）孤对电子和羰基产生共振相互作用，形成共振杂化体 ;3.肽键平面（酰胺平面） 参与肽键的六个原子位于同一平面，不能自由转动,称为肽平面。 ;（二）肽链（peptide chain）;方向性：N端（氨基端）和C端（羧基端） 氨基酸残基（amino acid residue 重复单位：N-Ca－C 肽链有形成氢键的倾向 ;二 、寡肽、多肽和蛋白质;谷胱甘肽(glutathione, GSH);Glu、Cys和Gly组成的三肽 Glu的?-羧基参与形成肽键 －SH为活性基团 ;GSH过氧化物酶;;三、 蛋白质的结构;;（一）一级结构（Primary structure）;6－10;(二) 二级结构(Secondary structure);2、二级结构的主要类型;;（1）α－螺旋;结构要点 ;氨基酸残基R侧链在螺旋外侧;;（2） β-片层（ β-折叠）（β-pleated sheet structure） ;2～数个肽段平行或反向平行聚积在一起；