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生物化学第2章 蛋白质PPT
2.3.2 生物活性肽的功能 P33 自己阅读。 2.3.3 活性肽的来源 P35 自己阅读。 2.3.4 活性肽的应用 P35 自己阅读。 肽链(蛋白质)的酶水解 肽链(蛋白质)的酶水解举例 2 . 4 蛋白质的结构 P36 2 . 4 .1 蛋白质的一级结构 P36 指氨基酸如何连接成肽键和氨基酸在肽链中的排列顺序; 2.4.2蛋白质的空间结构 P37 研究蛋白质构象的方法——x射线衍射法 一个特定蛋白质行使其功能的能力常由它的三维结构或构象决定 正常情况下,蛋白质以紧密折叠的结构存在; 蛋白质的天然折叠结构决定于3个因素: ① 与溶剂分子(一般是水)的相互作用; ② 溶剂的pH和离子组成; ③ 蛋白质的氨基酸序列(最重要因素); 蛋白质分子的结构中有多种力处于精细的平衡中,决定蛋白质独特构象; 肽链中相邻肽键的空间结构 3-1 P19 1)肽键键长0.132nm,介于C-N单键(0.147nm)和C=N双键(0.127nm)之间,且更接近于C=N,故肽键具有部分双键性质,不能自由旋转; 2)形成肽键的4个原子(C、O、N、H)和与之相连的2个α-碳原子共处在一个平面上,形成酰胺平面; 3)在酰胺平面中C=O与N-H呈反式; 肽链中相邻肽键的空间结构 3-2酰胺平面和两面角示意图 4)肽链的主链由许多酰胺平面组 成,α-碳原子是两个相邻酰 胺平面的连接点; 5)α-碳原子连接的两个键Cα- N键和Cα-C键是单键; 绕Cα-N键旋转的角度称φ角; 绕Cα-C键旋转的角度称ψ角; φ=0°ψ=0°时的主链构象 肽链中相邻肽键的空间结构酰胺平面和两面角示意图3-3 6)从Cα沿键轴看:顺时针旋转 的φ和 Ψ角为正值,反之为负 值; 7)当旋转键两侧的主链处于顺 时构型时规定ψ或φ=0°; 完全伸展的主链结构 (1)稳定蛋白质中空间结构的作用力 P37 蛋白质分子结构的稳定性靠分子中的多种化学键维持; 蛋白质分子如受某些理化等因素影响,结构发生改变,其性质和功能都会发生改变; 蛋白质分子中的化学键 1)共价键: 如肽键、二硫键(存在于两个半胱氨酸之间)、酯 键; 2)非共价键(次级键): 如氢键、离子键(又称盐键)、疏水键、范德华力等; 氢键、离子键和酯键存在于极性基团之间; 疏水键、范德华力存在于非极性基团之间; 稳定蛋白质三维结构的各种作用力图示 P38图2-6 稳定蛋白质三维结构的力 肽键是肽链的基本键,其他各种化学键参加链中及链间联系; 1)一级结构的肽链是由肽键-CO-NH-连接而成,同一肽链中不同部位有的还有二硫(-S-S-)桥键(如胰岛素),有的含有磷酸酯键或羧酸酯键; 2)二级结构的螺旋构象靠氢键维持; 3)三、四级结构的构象主要由次级键,包括氢键、离子键(盐键)、疏水键和范德华力等维持; (2) 蛋白质的二级结构 P38 ①α-螺旋结构 P38 是蛋白质中最常见、最典型、含量最丰富的二级结构; 1)蛋白质中的α螺旋几乎都是右手的,都是由L-氨基酸 残基构成; 2)α螺旋是重复性结构,螺旋中每个α-C的φ和ψ分别 在 -57°和-47°附近; 3)每圈螺旋占3.6个氨基酸残基; 每残基轴向高度为0.15nm; 每圈螺旋高度为0.54nm,沿轴旋转100°; 4)残基侧链伸向外侧; α-螺旋结构模式图 P20图1-4 续:α-螺旋结构 5)同一肽链内相邻螺圈之间形成氢键,其取向几乎与中心轴平行; 6)氢键是由每个肽基的C=O与其前面第3个肽基的N-H之间形成的; 7)氢键封闭环内原子数为13; 8)α螺旋在某些情况下可伸展, 如毛发纤维湿热时可拉长到 原长的2倍; 影响α螺旋形成的因素(阅读) 一条肽链能否形成α螺旋及形成的螺旋是否稳定,与它的氨基酸组成和序列有极大的关系: 1)R基电荷性质: R基小并且不带电荷的多聚丙氨酸,在pH7水溶液中能自发卷曲成α螺旋; 多聚赖氨酸在同样pH条件下不能形成α螺旋,而是以
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