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第三章 从DNA到RNA;本章将介绍生物信息的 传递的上半部分，即转录 ——从DNA到RNA。;基因作为唯一能够自主复制、永久存在的单位，其生理学功能以蛋白质形式得到表达。 DNA序列是遗传信息的贮存者，它通过自主复制得到永存，并通过转录生成mRNA，翻译生成蛋白质的过程控制所有生命现象。;转录（transcription）——生物体以DNA为模板合成RNA的过程。 转录后得到的RNA要经过加工才能变成成熟的mRNA 转录产物还可以变为rRNA和tRNA。 参 与 转 录 的 物 质： 底物 : 4种NTP ( ATP, UTP, GTP, CTP ) 模板 : DNA 酶 : RNA聚合酶 其他蛋白质因子;无论在原核还是真核细胞中，RNA链的合成都 具有以下几个特点： RNA按5’→3’方向合成 以DNA双链中的反义链为模板 不需要引物参与 合成的RNA有与DNA编码链相同的序列（A-U） 转录的基本过程包括：模板的识别，转录起始， 转录延伸，转录终止;A. 模板的识别 模板的识别阶段主要指RNA聚合酶与启动子DNA双链 相互作用并与之相结合的过程。 启动子是基因转录起始所必需的一段DNA序列，是基 因表达调控的上游顺式作用元件之一。 真核细胞中的模板识别与原核细胞有所不同，需要一 些转录调控因子（辅助蛋白），RNA聚合酶才能识别 启动子并形成转录前起始复合物（PIC）。;B. 转录起始 RNA聚合酶结合到启动子上以后，使启动子附近的DNA解旋并解链，形成转录泡以促使核糖核苷酸与模板DNA配对。 转录起始即是RNA链上第一个核苷酸键的产生。 无需引物。 起始后直到形成9个核苷酸的过程是通过启动子阶段，此时RNA聚合酶一直在启动子处，之后进入正常延伸。;C. 转录延伸 转录延伸即是RNA聚合酶释放σ因子离开启动子后，核心酶沿着模板DNA移动并使新生RNA链不断伸长的过程。 D. 转录终止 当RNA链延伸到终止位点时，RNA将停止合成，转录泡瓦解，DNA链复原，新生RNA链和RNA聚合酶将被释放下来。这即是转录终止。;二、转录系统的组成;A. RNA聚合酶 RNA聚合酶是转录过程中最关键的酶。 原核和真核生物的RNA聚合酶虽然都能催 化RNA的合成，但在其分子组成、种类和 生物化学特性上各有特色。;原核生物RNA聚合酶 在细菌中，一种RNA聚合酶 几乎负责所有mRNA、rRNA和tRNA的合成。 大肠杆菌RNA聚合酶： 2个α亚基 1个β亚基 1个β’亚基 1个σ亚基;转录的起始过程需要全酶，延伸过程仅需要核心酶。 各亚基的功能： α亚基可能与核心酶的组装及启动子的识别有关， 并参与RNA聚合酶和部分调节因子的相互作用 β亚基能与模板DNA、新生RNA链及核苷酸底物相 结合。 β亚基和β’亚基组成了聚合酶的催化中心，它们 在序列上与真核生物RNA聚合酶的两个大亚基同源。 。; σ因子的作用是负责模板链的选择与转录的起始，它是酶的别构效应物，使酶专一性识别启动子。 提高酶对启动子的亲和力，酶底物结合常数提高103倍 降低酶对非专一性位点的亲和力，非特异性结合常数降低104倍 某些细菌内含有能识别不同启动子的σ因子。;启动子-酶复合物形成，开链 单个核苷酸与开链启动子-酶复合物结合 新生RNA的5’端 6-9个核苷酸后，稳定酶-DNA-RNA三元复合物 释放σ因子，进入延伸期;真核生物RNA聚合酶;酵母的RNA聚合酶有12个亚基，晶体结构已定位了聚合酶Ⅱ的10个亚基，催化亚基位于两个大亚基间的缝中，当DNA进入聚合酶时下游的钳子（jaws）结构可夹住DNA链。;双环八肽──α-鹅膏蕈碱： 在不论何种真核细胞中，RNA聚合酶Ⅱ的活性均可被低浓度的α-鹅膏蕈碱所迅速抑制，而聚合酶Ⅰ却不被抑制。聚合酶Ⅲ对α-鹅膏蕈碱的反应则不尽相同:在动物细胞中聚合酶Ⅲ可被高浓度α-鹅膏蕈碱所抑制，而在酵母和昆虫细胞中则不会被抑制。;其它RNA聚合酶 除了前述两种RNA聚合酶，还有： T3和T7噬菌体RNA聚合酶。仅有一条多肽链组成， 相对分子质量小于1×105。 线粒体RNA聚合酶。仅有一条多肽链组成，相对分 子质量小于7×104，与T7噬菌体RNA聚合酶有同源性。 叶绿体RNA聚合酶。结构比较大，与细菌RNA聚合酶 相似，由多个亚基组成。;B. 转录复合物 在转录的不同阶段，RNA聚合酶将同DNA结合，形成不同的复合物： 在识别阶段，聚合酶与启动子可逆性结合形成封闭二元复合物。 接着，结合处DNA双链解开，封闭复合物变为开放二元复合物。 转录开始，由RNA聚合酶、DNA和新生RNA形成三元复合物。;除RNA聚合酶外，真核生物转录