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基于SRAP—PCR分析百合鳞片DNA提取

基于SRAP—PCR分析百合鳞片DNA提取   摘要:采用改良的CTAB法从百合(Liliwn lancifolium Thunb.)鳞片中提取DNA,采用紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳检测所提取的DNA质量,并进行SRAP-PCR分析。结果表明,改良的CTAB法提取的百合DNA A260 nm/A280 nm为1.69,浓度为0.30 μg/μL。琼脂糖胶电泳检测结果显示提取的DNA为清晰的条带,RNA去除干净,无降解现象。SRAP-PCR扩增产物多态性好,稳定性高,可用于遗传多样性分析。   关键词:百合(Liliwn);鳞片;SRAP;DNA提取   中图分类号:Q523 文献标识码:A 文章编号:0439-8114(2012)21-4896-03   DNA Extraction from Squama Leaves of Liliwn lancifolium for SRAP-PCR Analysis   LI Jia-min,ZHOU Xiu-ling   (College of Chemical and Biological Engineering,Yichun University,Yichun 336000,Jiangxi,China)   Abstract: Modified CTAB method was applied to extract DNA from squama leaves of Liliwn lancifolium Thunb.. Ultraviolet spectrophotometry and agarose gel electrophoresis as well as SRAP-PCR were adopted to test the quality of extracted DNA. The results showed that A260 nm/A280 nm of DNA was 1.69, and concentration was 0.30 μg/μL. The agarose gel electrophoresis showed that the DNA had clear band without degradation or RNA. The SRAP-PCR product was with good polymorphism and stability, which could be used for genetic polymorphism analysis of Liliwn.   Key words: Liliwn; squama leaves; SRAP; DNA extraction   相关序列扩增多态性(Sequence-related amplified polymorphism,SRAP)标记因具有简便高效、快速稳定、共显性和重复性好、便于克隆目标片段等优点而备受青睐,目前已成功地应用于作物遗传多样性分析、遗传图谱的构建、重要性状的标记以及相关基因的克隆等。中药百合来源于百合科植物卷丹(Lilium tigrinum)、百合(L. brownii var. viridulum)、细叶百合(L. pumilum)的干燥肉质鳞叶[1],具有养阴润肺、清心安神的功效,临床可用于阴虚久咳、痰中带血、虚烦惊悸、失眠多梦、精神恍惚等症的治疗。中国是百合的故乡,全世界百合属植物约有94个种,起源于中国的有47个种、18个变种[2],其中36个种、15个变种为中国特有。但目前中国种植的百合多数是从国外引进的,而国内现有的百合资源尚未得到充分的利用,且破坏和流失现象十分严重。对百合??研究也主要集中于中药材品种基源的整理以及化学成分的分析。为了充分发挥中国丰富的百合资源优势,进行中药百合的遗传育种,利用RAPD、SSR、AFLP等分子标记研究百合遗传多样性已有报道[3,4]。这些研究中所用百合基因组DNA主要提取自百合幼嫩鳞叶,采样受到季节限制。百合鳞片的采样不受时间限制,但含有较多的次生代谢产物,提取高质量的DNA有一定难度。本研究采用CTAB法从百合鳞片中提取总DNA,检测所提取DNA的浓度和纯度,为SRAP分析以及百合品种亲缘关系的研究奠定基础。   1 材料与方法   1.1 材料   卷丹百合(Liliwn lancifolium Thunb.)鳞片采集于江西万载县白水乡。新鲜百合鳞片清水冲洗后用70%(体积分数,下同)的乙醇消毒,无菌水冲洗3次,于-80 ℃冰箱保存备用。   主要仪器包括超低温冰箱(MDF-382E(N))、水浴锅(HH-4)、离心机(TGL-16B)、基因扩增仪(XP-G)、双稳定时电泳仪(DYY-6C)、紫外分光光度计(UV-

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