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儿科常见疱疹类毒分子诊断及其临床应用

(二)、研究内容、研究目标、拟解决的问题和今后研究思路 1、研究内容基础部分 (1)、以临床常见疱疹病毒感染的诊断为目标,经计算机查索核酸序列库,选取保守DNA区域设计引物,建立能扩增所有6-8种疱疹类病毒的PCR方法。对标准毒株HSVⅠ(F株)、HSVⅡ(G株)、CMV(169株)、EBV(B95-8株)、VZV(EF株),以及HHV6(GS株)进行PCR扩增,并选择其他病毒如HBV、细菌(大肠杆菌、金葡菌等)、真菌(新型隐球菌)作为对照,以摸索出进行通用引物PCR所需的最小检出量,及其各自反应体系的适宜条件。 (2)、在疱疹类病毒的可变区域设计特异性引物,建立扩增对各自特异病毒DNA的PCR方法,包括CMV、HSV、EBV、VZV、HHV6、HHV7、HHV8等的PCR方法。并比较各自特异PCR方法与通用引物PCR检测标准毒株其敏感性、准确性等方面的差异。 (3)、经核酸序列GenBank比较,设计各自特异的DNA探针,并进一步分子克隆、序列分析,明确HSV、HHV6的亚型基因,设计HSVⅠ/Ⅱ、HHV6A/6B等的特异性探针。 (4)、对设计的DNA探针末端修饰,微阵列,制作基因芯片。内容包括固相载体的选择、玻片表面修饰、探针末端修饰、微阵列制备技术、核酸探针的固定及杂交。 (5)、基因芯片杂交系统参数的确定及检测,包括DNA固液相杂交、荧光标记与检测方法,灵敏度及特异性测定等。 2、研究内容临床部分 我院临床有中枢神经系统感染,包括急性、散发性、局灶性脑炎,脑膜脑炎等患儿,收取脑脊液及外周静脉血,对全身不明原因发热、皮疹、黄疸、肝脾肿大等患儿抽取静脉血,进行DNA抽提、PCR扩增,阳性结果进一步进行基因芯片分析。 同时对临床标本血清(血浆)进行HSV、EBV、CMV等的特异性IgM、IgG检测。试图调查儿童疱疹病毒感染的实际情况,研究儿童病毒感染的早期诊断价值,发现特定疱疹病毒感染或混合感染情况,以阐明PCR-基因芯片在诊断及区分不同病毒感染时的实际意义。 在研究过程中,同时设立健康体检儿童的对照组及非病毒感染的脑脊液标本,进行PCR-基因芯片检测,以排除假阳性、假阴性等情况,拟在解决目前病毒感染缺乏早期、快速、准确诊断的问题。 3、研究目标 在疱疹类病毒高度同源序列的DNA多聚酶基因内设计通用引物扩增所有疱疹类病毒DNA,对其PCR扩增产物进行分子克隆、序列测定,通过序列分析找到各自特异的DNA序列及亚型序列,设计特异探针,建立疱疹病毒DNA基因芯片区分不同病毒感染,为临床疱疹类病毒感染的早期、快速诊断提供有效手段。 4、拟解决的问题 (1)、在疱疹病毒的高度同源序列选择通用引物,建立能检测CMV、HSV、VZV、HHV等所有疱疹类病毒的PCR方法。 (2)、在疱疹病毒的可变区选择特异DNA探针,并对HSVⅠ型与Ⅱ型、HHV6A与HHV6B等亚型进行分子克隆、序列分析,找到各自特异DNA序列,建立基因芯片,区分不同疱疹病毒及其亚型。 5、今后研究思路 * * 儿科常见疱疹类病毒分子诊断及其临床应用 磐安县人民医院 申屠桥民 一、儿科常见疱疹类病毒感染的病原体种类、危害及诊治现状 1、儿科常见疱疹类病毒感染现状 全世界每年有1300万因感染性疾病而死亡,其中1000万是5岁以下儿童,99%发生在经济欠发达的发展中国家,其死因的70%是因常见的感染性疾病引起。 随着科技水平的不断提高,各种抗生素、抗病毒药物日益增多,若能早期快速明确诊断系何种病原体感染,就能有效地控制儿童的病死率。然而,目前感染诊断在我国还局限于生化、培养、病原体分离等常规方法,缺乏早期、快速、准确诊断的方法 在常见感染性疾病中,细菌与病毒共占了90%以上(其中细菌与病毒各占45%左右)。在95重大攻关项目中,成功地创建了16SrRNA基因PCR—基因芯片快速、准确诊断不同细菌的感染,使细菌诊断上了一新的台阶,其研究成果也列入了全国新生儿败血症诊断标准。 但病毒的快速早期诊断方法仍未见报道。儿童是祖国的未来,如何早期明确诊断儿童病毒感染将是能否治愈病毒感染的关键。 2 、儿科疱疹类病毒感染的危害 儿童病毒感染造成严重危害涉及儿科与围产医学二大范畴。儿科领域中,病毒感染致死的主要原因是中枢神经系统感染,典型的感染为单纯疱疹病毒Ⅰ型(HSVⅠ)所致的脑膜脑炎(HSE)。 HSE是散发性病毒性脑炎中最常见的病原。其次表现为发热、肝脾淋巴结肿大等原因不明的病毒感染,最具代表性的疾病是传染性单核细胞增多症。目前已知主要是由于EB病毒感染所致。EB病毒还对神经系统危害严重,如引起脑膜脑炎、格林巴利综合症、Fisher’s综合症等。 在围产医学中,病毒感染的危害在于宫内感染,最具典型的是巨细胞病毒(CMV),其次是单纯疱疹

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