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计算化学绪论课件
计算化学;;关于计算化学;一 什么是计算化学; 由于化学、数学、计算机科学之间的相互渗透和交叉,以及新的实验手段和计算机的广泛使用,产生的一门新科学——计算化学。;什么是计算化学;什么是计算化学
;计算化学;1925年,海森堡 Heisenberg发表了第一篇量子力学的文章,一个新的学科---“计算化学”诞生了;
1933年,Bernal, J. D.和Flowler, R. H提出了水的原子模型;
1946年,Frank Westheiner完成了第一次分子力学计算;
1959年,Kauzmann提出疏水作用是稳定蛋白质结构的主要作用的一种;
1969年,Levitt, M和Lifson, S. J报道了第一次采用分子力学的方法对蛋白质结构进行优化;;1979年,Levitt等人采用了分子动力学方法揭示了X射线晶体衍射B因子的起源;
1989年,Allinger等人发布了分子力学与分子动力学模拟程序MM3;
1998年 美国化学家库恩(Walter Kohn)和英国科学家波普尔(John A. Pople)因为对量子化学的贡献获得诺贝尔化学奖; 同年,IBM投资10亿美元,研制速度为1000万亿次/每秒的超级计算机蓝色基因,用于生物分子的模拟研究;
2000年 第一届国际结构基因组会议召开,美、英、法、德、加拿大、荷兰、以色列、意大利、日本9个国家开始结构基因组计划的合作;
2003年 Pengyu Ren和Jay W. Ponder提出了水的AMOEBA模型,这是一种可极化的水的结构模型;;计算化学这一门边缘科学历史很短,但涉及面很广,
在计算机方面包括——硬件
软件
语言
计算方法
在化学方面包括——无机化学、有机化学、分析化学、
高分子化学、结构化学、环境化学
所用计算方法包括——线性代数、微积分、数值逼近、
概率统计、最优化、拓扑、数据库;1. 以计算机体系为主的计算化学
2. 以计算数学为主要体系的计算化学和化工
3. 以化学应用为主的计算化学
4. 以介绍应用程序为主的计算化学
5. 以介绍在化学分析仪器中使用电子计算机为主 的计算化学;1.模式识别在化学中的应用
2.计算机模拟在化学中的应用
3.量子化学计算方法
4.化学数据库;1.促进了理??化学的发展
2.测试仪器的改进
3.化学情报的检索
4.数据库的建立
5.智能模型的发展
6.实验室成果的工业化
7.化学教学的应用
8.实验数据的处理;地位:
? 促进化学界的研究方法和工业界的生产方式不断革新。
?是绿色化学和绿色化工的基础,是联系化学化工为国民经济可持续性发展服务的桥梁。
?中科院院士徐光宪先生在其报告中称“理论化学和计算化学的基础及应用研究”是21世纪化学的11个突破口之一。
;计算化学的过去、现在和未来;计算化学发展史;A History of Computational Chemistry; 1958—1970; 1971—1980 ; 1981—1990; 1991—2005;量子化学计算发展史 ;矩阵力学;狄拉克方程 ;量子化学计算发展史;MO-HMO(Huckel引入了某些近似)-半经验的MO(忽略了双电子积分)-Hartree-Fock-Roothann方法,自恰场迭代方法-MO的从头算研究(进行全电子体系非相对论的量子力学方程计算)Gaussian是进行从头算的鼻祖,从70到98,每两年更新一次。Gaussian的核心思想:50年代的时候,使用类氢离子波函数为基函数,后来使用Slater函数(STO)为基函数,后来又采用Gauss函数拟合STO。80年代,是量子化学计算飞速发展的时期。赝势是针对重原子体系而提出的。80年代初,唐敖庆先生在吉林大学举办了全国量子化学研讨班。徐光宪先生率先用GAUSSIAN程序开展量化从头算研究。以上这些,都是对单一分子的研究。;90年代,以密度泛函理论为基础的DFT方法迅速发展起来。最大的特点:轨道波函数为基-密度函数为基。由此引申出的方法有广义梯度近似(GGA)、密度泛函与分子轨道的杂化方法(B3LYP)。我国的X
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