教学用于细菌鉴定和分类的分子生物学方法ppt课件.pptVIP

;主要内容;DNA-DNA杂交;DNA-DNA杂交;结果的判定：一般认为核酸杂交同源性小于 20％为不同菌属，20％ ～60％ 为属内紧密相 关的种，60％ ～70％为同种内不同亚种，大 于70％为同一亚种。 ;16SrDNA在细菌分类鉴定的应用;其序列包含10 个可变区（variable region）和11 个恒定区（constant region），其中V1、V2、V3和V4共4个高变区，尤其是V2这一高变区，由于其进化速度相对较快，其中所包含的信息，足够用于物种属及属以上分类单位的比较分析。因此，Johes S W和Neller H F等报道测定16 S rDNA基因的部分序列即可达到鉴定的目的;;细菌核心基因（看家基因）;1.信息的存储和加工 DNA的代谢：（1）基本的复制功能（2）DNA的修复、限制和 修饰 RNA的代谢 ： （1）基本的转运功能（2） 翻译 （3） RNA的降解 2 蛋白质的加工、折叠、分泌 3 细胞的结构和细胞壁的加工 4 活跃且处于中间的代谢 ;gyrB基因;DNA促旋酶是一种细菌Ⅱ型拓扑异构酶，在DNA复制及DNA超螺旋结构的维持过程中起着重要的作用。 （1）gyrB基因序列全长约为1．2—1．4 kb，平均碱基替换率为每100万年变化0．7％~0．8％ ，比16SrDNA的每5000万年变化1％的速度快。 （2）由于其作为蛋白编码