内蒙古浑善达克盐碱湖细菌多样性研究-bacterial diversity in hunshandake saline-alkali lake in inner mongolia.docxVIP

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2018-07-27 发布于上海
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内蒙古浑善达克盐碱湖细菌多样性研究-bacterial diversity in hunshandake saline-alkali lake in inner mongolia.docx

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内蒙古浑善达克盐碱湖细菌多样性研究-bacterial diversity in hunshandake saline-alkali lake in inner mongolia

目录1引言.............................................................11.1极端环境及极端环境微生物.....................................11.1.1极端环境...................................................11.1.2极端环境中的微生物.........................................11.2盐碱湖中的微生物.............................................51.3内蒙古盐碱湖研究概况.........................................61.4微生物多样性.................................................61.4.1微生物多样性的概念与表征...................................61.4.2微生物多样性的研究方法.....................................71.5本研究的内容、目的和意义....................................112材料与方法......................................................122.1实验材料....................................................122.1.1主要试剂与试剂盒..........................................122.1.2主要仪器..................................................122.1.3主要溶液与缓冲液的配置....................................122.1.4培养基配方................................................142.1.5引物......................................................142.1.6序列分析工具与软件........................................152.2实验方法....................................................152.2.1样品采集与处理............................................152.2.2水质参数的测定............................................162.2.3基因组DNA的提取182.2.416SrDNA的PCR扩增192.2.5琼脂糖凝胶回收PCR产物192.2.6目的片段的连接反应........................................202.2.7感受态细胞DH5α的制备202.2.8重组质粒的转化............................................212.2.9阳性克隆子的鉴定..........................................212.2.10测序与系统发育分析.......................................222.2.11微生物多样性指数分析.....................................223结果与分析......................................................233.1浑善达克盐碱湖环境参数......................................233.2纯培养样品中菌株分离鉴定及细菌群落分析......................233.2.1分离菌株基因组DNA的提取233.2.2菌株16SrDNA的PCR扩增243.2.3阳性克隆的PCR鉴定243.2.4分离培养细菌的系统发育分析................................253.3环境样品16SrDNA文库的构建及细菌群落分析303.3.1环境样品总DNA的提取3016SrDNA的PCR扩增3116SrDNA文库的构建313.3.4环境样品细菌多样性指数分析及文库间相似性分析..............323.3.5环境样品细菌系统发育分析.................