蒙特卡洛构象搜索结合量子化学方法对木犀草素-74-o-β-d-葡萄糖苷的研究-study on luteolin - 74 - o - β - d - glucoside by monte carlo conformational search and quantum chemistry method.docxVIP

关于学位论文独创声明和学术诚信承诺 本人向河南大学提出硕士学位申请。本人郑重声明：所呈交的学位论文是本人在导 师的指导下独立完成的，对所研究的课题有新的见解。据我所知，除文中特别加以说明、 标注和致谢的地方外，论文中不包括其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不包括其 他人为获得任何教育、科研机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同事对 本研究所做的任何贡献均已在论文中作了明确的说明并表示了谢意。 在此本人郑重承诺：所呈交的学位论文不存在舞弊作伪行为，文责自负。 学位申请人（学位论文作者）签名： 2013 年 月 日 关于学位论文著作权使用授权书 本人经河南大学审核批准授予硕士学位。作为学位论文的作者，本人完全了解并同 意河南大学有关保留、使用学位论文的要求，即河南大学有权向国家图书馆、科研信息 机构、数据收集机构和本校图书馆等提供学位论文（纸质文本和电子文本）以供公众检 索、查阅。本人授权河南大学出于宣扬、展览学校学术发展和进行学术交流等目的，可 以采取影印、缩印、扫描和拷贝等复制手段保存、汇编学位论文（纸质文本和电子文本）。 （涉及保密内容的学位论文在解密后适用本授权书） 学位获得者（学位论文作者）签名： 2013 年 月 日 学位论文指导教师签名： 2013 年 月 日   摘 要 本工作首先应用混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法对双甘肽、去质子化双甘肽、 双甘肽氯离子复合物和双甘肽二水复合物进行计算研究，确定蒙特卡洛构象搜索时哪种 力场最适合低聚物体系的研究。然后应用混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法对木犀 草素 -7/4-O-β-D-葡 萄 糖 苷 进 行 计 算 研 究 ； 另外，应用 “tree-step” 计算法对 木犀草素 -4-O-β-D-葡萄糖苷进行计算研究，比较混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法和 tree-step 计算法的优缺点。最后应用混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法对胸腺嘧啶 和尿嘧啶及其水合进行计算研究。本文首先简要地介绍了计算过程中用到的蒙特卡洛构 象搜索、力场、几何优化、 单点能、频率分析、零点能、基组和 tree-step 计算法，然 后详细地阐述了开展的研究工作。主要包括以下几个内容： 1、应用混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法预测双甘肽、去质子化双甘肽、双 甘肽氯离子复合物和双甘肽二水复合物的稳定构象。对每个研究对象进行蒙特卡 洛构象搜索时，都分别选用了 AMBER、MM3、MMFFs 和 OPLS-2005 力场。计 算结果表明这四种力场中 MMFFs 力场对双甘肽、双甘肽氯离子复合物和双甘肽 二水复合物描述的最好。 2、应用混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法预测木犀草素-7-O-β-D-葡萄糖苷低 能量构象。获得 13 个 6 kJ/mol 以内的木犀草素-7-O-β-D-葡萄糖苷构象。构象分 析表明协作的环内氢键对分子的稳定性起着很重要的作用。 3、分别应用混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法和 tree-step 计算法预测木犀 草素-4-O-β-D-葡萄糖苷低能量构象。4 kJ/mol 以内，这两种方法预测了相同的 构象。相对于混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法，tree-step 计算法节约了 计算成本，减少了计算时间。 4、应用混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法探究胸腺嘧啶和尿嘧啶与水分子的 相互作用。 I  PAGE 4 III 关键词：混合的蒙特卡洛构象搜索/量子化学方法，tree-step 计算法，木犀草素-7/4-O-β-D- 葡萄糖苷，双甘肽，去质子化双甘肽，双甘肽氯离子复合物，双甘肽二水复合物，胸腺 嘧啶，尿嘧啶  ABSTRAT Firstly, GlyGly, [GlyGly-H]-, [GlyGly + Cl]- and GlyGly·(H2O)2 are computationally studied using the hybrid Monte-Carlo Multiple Minimum /quantum chemical approach (the hybrid MCMM/QC approach) in this work in order to determine the most suitable force field for the systems in Monte Carlo conformational search. Secondly, Luteolin-4-O-β-D-glucoside is computationally studied using the hybrid MCMM/QC approach; in addition, Luteolin-4-O-β-D-glucoside