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HIV―1型Nef基因重组表达载体构建及其稳定表达细胞系建立
HIV―1型Nef基因重组表达载体构建及其稳定表达细胞系建立
摘要为了构建艾滋病毒HIV1型Nef基因重组表达载体,利用PCR从pNL43质粒上扩增 HIV1型Nef基因,获得Nef基因完整的编码区,构建可表达Nef蛋白的 pEBmycnef重组表达载体.经鉴定正确后,利用 LipofectamineTM 2000将重组质粒转染SW480细胞,通过Western Blot技术检测 Nef蛋白的瞬时表达.为了建立稳定表达Nef基因的SW480?胞系,采用G418筛选建立稳定表达细胞系的方法,筛选出单克隆细胞系.扩大培养克隆细胞后,通过RTPCR和Western Blot分别检测Nef的mRNA转录水平及蛋白表达水平,经长达60 d的传代,最终获得稳定表达Nef基因的SW480细胞系,为研究RNAi在艾滋病治疗方面的应用提供了细胞模型.
关键词Nef基因;SW480细胞;G418;稳定细胞系
艾滋病(AIDS)全称为“获得性免疫缺陷综合征”,是一种由人免疫缺陷病毒(HIV)引起的,以全身免疫系统严重损害为特征的传染性疾病.RNA干扰(RNAi)是细胞内序列特异性抑制靶基因表达的机制,具有高效性、特异性和副作用小的特点,将其应用于抗HIV1 治疗研究是近来研究热点[12].RNAi抑制HIV1的复制,最直接的方法就是利用RNAi方法直接干扰HIV1病毒的RNA,据文献报道几乎HIVl的所有基因都可作为干扰的靶点:如LTR[3]〖KG-*6〗,gag[45]〖KG-*6〗,pol[6]〖KG-*6〗,vpu[7]〖KG-*6〗,vif[5]〖KG-*6〗,tat[8]和env[9]等基因.RNAi还可以将干扰的位点靶定到细胞上与HIV病毒感染密切相关的受体蛋白、辅助受体蛋白或其他的一些细胞因子[10].
负调控因子(negative factor,Nef) 是人免疫缺陷病毒( HIV) 附属蛋白之一,相对分子质量小,柔韧性大,核心结构呈球形.Nef 不具酶活性,具有衔接蛋白的作用,可下调 CD4,主要组织相容性复合体Ⅰ(MHCⅠ),主要组织相容性复合体Ⅱ(MHC Ⅱ)和 CD28 分子,在对抗宿主免疫应答过程中发挥重要作用.Nef 可增强病毒的复制和感染性,抑制 HIV 感染细胞的凋亡,在 HIV 致病机制方面也发挥关键作用.基于Nef在体内的致病机制,多种抗HIV1病毒策略被提出,使Nef成为潜在的HIV1靶点.本文试图构建稳定表达HIV1型Nef蛋白的SW480细胞系,为研究RNAi在艾滋病治疗方面的应用提供细胞模型.
1材料和方法
1.1材料
大肠杆菌TOP10感受态细菌、pEBMultineomyc质粒、pNL43质粒、SW480细胞(人结肠癌细胞)均由本实验室保存;RNA提取试剂TRIzol和LipofectamineTM2000转染试剂购自Invitrogen公司; Ex Taq DNA聚合酶、T4 DNA连接酶、限制性内切酶BamHⅠ与NotⅠ购自ThermoFisher公司;DNA胶回收试剂盒、质粒提取试剂盒和去内毒试剂购自广州东盛生物科技有限公司;G418购自Sigma公司;小鼠源Antimyc抗体、内参蛋白actin抗体和HRP标记羊抗小鼠IgG均购自Santa Cruz公司;细胞培养所用的DMEM培养基和胎牛血清购自美国HyClone公司;其他常规试剂与耗材均购自于上海生工生物科技有限公司.
1.2引物设计合成
参照pNL43质粒上HIV1型Nef基因序列,利用Primer Premier 5 以及Nebcutter 2.0软件设计的引物如下:Nef正向引物,5′CGCGGATCCGGGTGGCAAGTGGGTC3′;Nef反向引物,5′ATTTGCGGCCGCTCAGCAGCTCTTGAAGTAC 3′.分别在上游引物和下游引物5′端加上了BamHⅠ和NotⅠ酶切位点和相应的保护碱基,引物由上海生工生物有限公司合成.
1.3HIV1型Nef片段的扩增
以pNL43质粒为模板,使用Ex Taq DNA聚合酶,采用PCR扩增全长HIV1型Nef基因编码区,全长640 bp.PCR扩增体系(20 μL):10× Buffer 2 μL,10 mmol/L dNTP 0.5 μL,0.5 g/L pNL43质粒 1 μL,正向引物和反向引物(10 nmol/L)各1 μL,Ex Taq DNA聚合酶 0.25 μL,ddH2O 14.5 μL.PCR 的扩增条件:94 ℃预变性2 min;94 ℃变性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸50 s,共进行32个循环,72 ℃继续延伸10 min.得到的PCR产物经过1%的琼脂糖凝胶电泳鉴定后,根据
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