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siRNA介导FOXA2基因沉默对乙肝病毒复制影响
siRNA介导FOXA2基因沉默对乙肝病毒复制影响
[摘 要] 目的:探讨小干扰RNA(small interfering RNA,siRNA)介导的FOXA2基因沉默对乙肝病毒(HBV)复制的影响。方法:设计靶向FOXA2基因siRNA序列,构建质粒转染HuH-7人肝癌细胞。用QT-PCR和 RT-PCR 检测细胞FOXA2基因mRNA变化;用Western blot检测细胞FOXA2蛋白变化;用Northern blot分析FOXA2基因沉默后HBV RNA表达。结果:构建FOXA2基因稳定沉默的F-S细胞株,FOXA2基因与蛋白沉降效率明显。FOXA2基因沉默后,HBV病毒3.5kbRNA升高,FOXA2抑制HBV病毒的复制。结论:FOXA2基因通过降低3.5kbRNA的表达抑制乙肝病毒的复制。
[关键词] siRNA;FOXA2;乙肝病毒
中图分类号:R575.1 文献标识码:A 文章编号:2095-5200(2016)02-052-03
DOI:10.11876/mimt201602019
乙肝病毒(HBV)引起的传染性疾病。HBV是双链环形结构[1],3.5kbRNA包含C(核抗原)/P(DNA多聚酶)/S(表面抗原)/X(X蛋白),是HBV进行复制的关键因子。FOXA[2-3]是核转录因子,由FOXA1、FOXA2、FOXA3构成。FOXA是肝转录因子之一,在肝器官的形成和发展及肝进行新陈代谢过程中发挥重要作用。FOXA也是HBV复制的关键调控点,因为HBV病毒所有的启动子和增强子均包含FOXA结合位点。大量实验表明HBV转基因鼠中转入FOXA2,HBV复制降低,进而推断FOXA2可以抑制HBV的复制。因此我们设计靶向FOXA2的siRNA序列,构建质粒转染人肝癌细胞HuH-7,观察FOXA2基因沉默后对乙肝病毒复制的影响。
1 材料
质粒载体(上海吉凯基因公司);jetPRIME Transfection Reagent (Polyplus );Trizol(Invitrogen);核酸提取试剂盒(庄盟国际生物基因公司);Maxima SYBR Green QT-PCR Master Mixes(Thermo Fisher Scientific company);HiFi-MMLV Two Step RT-PCR Kit (北京康为世纪生物公司);Golden view(庄盟国际生物基因公司);β-Actin单克隆抗体(Cell Signaling company );FOXA2抗体(Abcam company);miRNA Northern blot reagent (TAKARA company);ECL显色试剂盒(Thermo Fisher Scientific company )。
2 方法
2.1 细胞培养
HuH-7细胞用含10%胎牛血清的DMEM培养基,在37℃、5% CO2 条件下孵育箱内培养。EDTA胰酶消化HuH-7细胞,取对数生长期细胞实验。
2.2 细胞转染及筛选
将1.5×105 HuH-7细胞接种于6孔板中,37℃、5% CO2 孵育箱中过夜。待HuH-7细胞贴壁覆盖率70%~80%时,换新培养液,将含FOXA2-siRNA的质粒与jetPRIME转染试剂按1:2混合滴加到6孔板1、2、3孔细胞上。同时将不含靶序列空质粒与jetPRIME转染试剂按照同样比例滴加到6孔板4、5孔细胞上。第6孔为阴性对照只加培养液(阴性组)。转染3周后挑取单克隆进行鉴定。将FOXA2基因沉默细胞株命名为F-S细胞株;空质粒细胞株命名为K-S细胞株。提取F-S细胞株、K-S细胞株、HuH-7细胞基因和蛋白,用QT-PCR、RT-PCR及Western blot对siRNA介导FOXA2基因沉默进行验证。
2.3 QT-PCR、RT-PCR 法检测FOXA2基因mRNA
表达
用Trizol试剂1mL分别裂解F-S细胞株、K-S细胞株、HuH-7细胞株;加入0.2mL氯仿,颠倒混匀待两液相分层后离心,取上清液至新EP管中;加与上清液等体积异丙醇混匀,室温放置20min,离心弃上清;加入无水乙醇离心弃上清液并风干;加入30μL RNAase-free ddH2O,反复吹打混匀,获得细胞总RNA,经反转体系得到cDNA。QT-PCR条件:底物液12μL,H2O7.5μL,引物(FOXA2、Actin)2μL,模板2μL。RT-PCR对FOXA2基因引物进行扩增,条件如下:98℃ 10s,60℃30s,72℃30s,32个循环。RT-PCR产物用1%琼脂糖凝胶电泳后用凝胶成像仪显示,以ActinPCR扩增作为内参对照。
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