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实时荧光定量PCR检测非小细胞肺癌组织中SP70表达及意义
实时荧光定量PCR检测非小细胞肺癌组织中SP70表达及意义
【摘要】 目的 探讨非小细胞肺癌(NSCLC)组织中SP70抗原的表达及意义。方法 选取40例肺癌组织作为肺癌组[NSCLC 32例(NSCLC组), 小细胞肺癌8例(小细胞肺癌组)], 另取20例良性病变肺组织作为肺良性病变组, 采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)相对标准曲线法检测各组中SP70抗原表达的相对水平, 定量分析其与临床组织病理学特征的关系。结果 肺癌组SP70平均表达水平为(1.798±1.275)pmol/μl, 明显高于肺良性病变组的(0.921±0.238) pmol/μl, 差异有统计学意义(P0.05)。结论 SP70可能是评价NSCLC的一个潜在的指标。
【关键词】 SP70抗原;非小细胞肺癌;实时荧光定量聚合酶链反应
DOI:10.14163/j.cnki.11-5547/r.2017.12.030
寻求肺癌早期检测指标及方法是目前研究热点, 近期有研究发现一株能特异性识别NSCLC的McAbNJ00l, 此抗体对NSCLC的免疫性诊断和治疗意义重大, 其所针对的靶抗原为相对分子质量70000的胞浆新抗原SP70, SP70与NSCLC关系密切[1]。本研究采用实时荧光定量PCR(Q-PCR)相对标准曲线法检测40例肺癌组织和20例良性病变肺组织中SP70的表达水平, 分析其表达与临床组织病理学特征的关系, 评价其在临床诊治中的应用价值。
1 材料与方法
1. 1 材料来源 本院2014年8月~2015年6月手术切除的肺癌组织40例作为肺癌组, 其中NSCLC 32例(NSCLC组), 小细胞肺癌8例(小细胞肺癌组)。另取20例手术切除的肺良性病变组织作对照(肺良性病变组), 均由病理确诊, 标本收集后立即保存于-80℃冰箱。Trizol液和逆转录试剂盒购自美国Invitrogen公司。TSYBR GreenI荧光染料:北京天根公司。引物由北京诺赛基因公司设计并合成, 目的基因SP70 F: 5′- CCAGTTCAAGTGCTCGG CAT-3′;R: 5′- TTGCTC TTGGAACCTCGGAC-3′。内参β-actin F: 5′-GTGACGTTGACATC CGTAAAGACC-3′;R:5′-CTAG GAGCCAGGGCAGTAATCT -3′。荧光定量PCR仪:Step one V2.1(美国ABI公司)。
1. 2 方法
1. 2. 1 总RNA提取及cDNA合成 按Trizol裂解抽提法提取总RNA, 常规检测其纯度、浓度及完整性, 将RNA逆转录合成cDNA后存放-20℃冰箱备用。
1. 2. 2 标准曲线的制备 将PCR产物目的条带通过吸附柱式琼脂糖DNA回收法进行回收纯化, 测其浓度后再以10倍系列梯度进行连续倍比稀释成106~101 copies/μl数量级的标准品, 进行实时荧光定量PCR扩增生成标准曲线。
1. 2. 3 相对标准曲线法实时荧光定量PCR扩增 每份标本均扩增SP70和β-actin, 20 ul反应体系:SYBR GreenI reaction mixture:10 ul, 目的基因(10 pmol/μ1)上、下游引物各0.4 μl, cDNA模板2 μl, ddH2O:17.2 μl。反应条件:95℃预变性2 min, 然后95℃20 s, 60℃30 s, 68℃45 s共40个循环, 按PCR仪默认条件进行溶解曲线分析, 每份标本重复3次, 通过扩增曲线及溶解曲线判定结果是否是阳性。
1. 2. 4 数据的标化处理 以同一样本β-actin模板量为参照, 标化计算SP70的相对模板数, 即:SP70/β-actin。
1. 3 统计学方法 采用SPSS19.0统计学软件对数据进行统计分析。计量资料以均数±标准差( x-±s)表示, 采用t检验。P0.05表示差异具有统计学意义。
2 结果
2. 1 荧光定量PCR评价指标 SP70标准曲线线性关系良好。见图1。扩增效率R20.998, 溶解曲线只有一个单峰。见图2。特异性高, PCR产物在87.0℃以上获得单一熔解峰, 经琼脂糖电泳后所得产物是目的基因SP70所要扩增的条带。
2. 2 实验结果 肺癌组SP70平均表达水平为(1.798±
1.275)pmol/μl, 明?@高于肺良性病变组的(0.921±0.238) pmol/μl,
差异有统计学意义(P0.05);NSCLC组SP70平均表达水平为(2.334±1.268)pmol/μl, 高于小细胞肺癌组的(1.171±
1.286)pmol/μl, 差异有统计
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