猪RTL1基因多态性及其与胴体肉质性状关联分析.docVIP

猪RTL1基因多态性及其与胴体肉质性状关联分析 　　摘要：旨在研究反转录转座子1基因（retrotransposon-like-1，RTL1）潜在的变异与猪胴体和肉质性状的相关性。测序发现在猪RTL1基因编码区1 209 bp处存在G/A突变，利用PCR-Fnu4H I-RFLP方法在9个猪种中进行了基因分型，并且在360头大白猪×梅山猪F2代群体中进行性状关联分析。结果表明，该位点与皮率、内脂率、6-7腰椎间膘厚、胸腰椎间膘厚、背最长肌pH、股二头肌肌肉色值呈显著相关（P0.05），与骨率、肩部膘厚、臀部膘厚、平均背膘厚、背最长肌失水率、背最长肌系水力、背最长肌肌肉色值呈极显著相关（P0.01）。 　　?P键词：猪；RTL1基因；单核苷酸多态性；性状关联分析 　　中图分类号：S828.2 文献标识码：A 文章编号：0439-8114（2017）20-3948-04 　　DOI：10.14088/ki.issn0439-8114.2017.20.038 　　Abstract： This study was conducted to investigate the potential association of variation in the retrotransposon-like-1 （RTL1） gene with carcass and meat quality traits in pigs. Cloning and sequencing found that there was a G/A mutation at 1 209 bp in the porcine RLT1 gene coding region. Using PCR-RFLP， SNP of RTL1 gene was detected in nine different pig breeds and performed associations with carcass and meat quality traits in 360 Large White and Meishan F2 hybrids. The results showed this polymorphism is significant association with skin percentage，internal fat rate，6-7 rib fat thickness，thorax-waist fat thickness，Meat pH（m.longissimus Dorsi，LD） and meat color value（BF）（P0.05），is higher significant association with bone percentage，shoulder fat thickness，buttock fat thickness，average backfat thickness，longissimus dorsi drip loss rate，longissimus dorsi water holding capacity and meat color value （LD）（P0.01）. 　　Key words： pig； RTL1 gene； single nucleotide polymorphism （SNP）； association analysis 　　反转录转座子1基因（Retrotransposon-like-1，RTL1），又名父本表达基因11（paternally expressed gene 11，Peg11）， 在人和小鼠中为父本表达的印记基因，不含内含子序列[1，2]。RTL1基因在胚胎和胎盘组织中表达量很高，对母体胎盘与胎儿的营养传递起着重要作用，敲除该基因的小鼠表现为胎儿死亡率升高、新生儿生长停滞、胎盘尺寸偏小[3]； 与人的胎儿发育和??生儿的生长也有密切关系[4，5]。该基因位于DLK1-DIO3印记区域，该区域基因对肌肉发育和脂肪沉积有一定的影响[6，7]，在转基因小鼠中异位表达RTL1基因，会导致肌肉肥大[8]；此外，该基因与callipyge绵羊的肌肉肥大相关，双肌臀的绵羊中RTL1基因的表达量是正常绵羊中的12倍[9，10]。RTL1基因与动物的生长和肉质性状有着密切的关系。目前关于此基因在猪中的研究较少，本研究分离克隆了RTL1基因，对其遗传多态性进行了筛选，并与猪胴体和肉质性状进行关联分析，以期获得猪生产性状相关的新分子标记。 　　1 材料与方法 　　1.1 试验材料 　　采集大白猪和梅山猪（华中农业大学试验猪场）各4头血样，提取基因组DNA，用于基因克隆及多态性检测； 　　大白猪×梅