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生物信息学学生创新能力培养体系探索与实践 　　摘 要：生物信息学在高校生物相关专业往往作为必修或选修课开设，对学生的创新能力的培养具有重要意义。在生物信息学课堂教学、实验教学、课外大学生创新训练项目、毕业设计等环节开展教学实践，构建学生创新能力培养体系，有助于提高教学质量。 　　关键词：生物信息学；创新能力；高校 　　中图分类号：G640 文献标识码：A 文章编号：1002-4107（2016）06-0078-02 　　随着生命科学在21世纪的不断发展，新的学科不断涌现。生物信息学作为交叉学科之一，与生物技术的各个领域具有密切关系，并对医药、卫生、农业等产业发展具有重要影响[1]。鉴于生物信息学对相应的基础学科发展和产业应用的重要作用，“生物信息学”课程首先在高校的研究生教学中开设，后逐步纳入到本科专业教学中。黑龙江八一农垦大学生物技术专业自2003年设立就开设了“生物信息???”课程，目前在黑龙江八一农垦大学的多个本科专业和生命相关研究生专业中开设此课程。近几年，浙江大学、武汉大学、华中科技大学、哈尔滨医科大学等十几所高校已经增设了生物信息学本科专业[2]。由此形成了完整的本科、研究生生物信息学人才培养体系，为社会培养了大量生物信息学人才，推动了生物相关高新技术产业的不断发展。 　　“生物信息学”在高校生物相关专业往往作为必修或选修课开设，主要讲授与生物相关的各类生物信息的收集、储存、获得与分析方法。课程体系和教学方法经过十几年的教学探索[3-6]，逐渐完善。但是由于生物信息学学科本身的迅速发展，对课程内容、教学方法等不断提出新的挑战。同时也是高校教学质量提升的内在要求，仍需大量的教学改革实践与探索。笔者在“生物信息学”教学过程中，结合自己多年的教学实践[7-8]，进一步提出多环节的“生物信息学”课程创新培养体系，包括在课堂教学、实验教学、课外大学生创新训练项目、毕业设计等不同的教学环节开展“生物信息学”的教学实践，提高“生物信息学”的教学质量，提升学生科研创新能力和实践应用能力。 　　一、丰富生态课堂教学实践，更新教学内容 　　课堂教学是培养学生创新能力的重要教学环节。生物信息学与现代的网络和信息技术密不可分，因此，实现信息技术与课程教学的有效整合是教学成功与否的关键所在。在教学过程中，以现代的教育生态观为指导开展课堂教学活动，构建了以多媒体网络同步教学系统为基础的生态课堂。在生态课堂教学实践中，教师更多的是为学生提供信息化的学习环境和资源，更注重与学生的实时交流。信息化学习环境中包括相关资源、各类网络中交流工具。教师在信息化的学习环境中除了课堂传授知识、监控管理以外，主要是通过查看学生的学习状况，指导学生的实践操作，解答学生的疑问以及师生讨论交流为学生提供建议和指导，促进学生自我的知识建构。目前网络开放课程已经成为新兴的教育资源，在教学中鼓励学生充分利用这些优质资源进一步开阔视野，例如北京大学的网络开放课程“生物信息学”、中科院的生物信息学网络课程资源以及国外的生物信息学教学培训网络资源。 　　课堂实训作为课堂教学的重要教学方法，可以充分锻炼学生的实践创新能力，让学生在实践训练中开展知识建构。有些学生甚至可以在完成教学基本要求的基础上，独立的开展深入的学习，掌握更多的生物信息学分析方法和软件。课堂实训均以生物相关专业的问题设计，例如微生物分类学中的16S rDNA分子鉴定分析中的系统进化分析，酶工程里面的酶结构模拟，基因工程中的基因预测、引物设计、酶切位点分析等。这些内容将多学科内容融为一体，有助于培养学生的创新思维，引导其发现和思考科学问题。 　　在课堂教学过程中，注重对生命科学进展的追踪。将最新生命科学内容引入到教学中来，不断完善“生物信息学”的教学内容。例如第二代测序技术产生的海量数据的处理方法，非编码RNA的介绍与生物信息分析，宏基因组测序数据的获得与分析等。 　　二、以问题为导向开展实验教学 　　为培养学生科学思维和创新意识，“生物信息学”的实验教学内容以问题为导向，培养学生综合运用生物信息学知识和方法，解决其它生物学相关学科中实际问题的能力。通过优化实验教学内容，系统的、全面的训练学生进行生物信息分析的基本操作和基本技能。实验教学以综合性、设计性实验为主。在实验过程中，学生需要根据自己的兴趣自由选择实验分析的序列或分析的对象，并自行设计实验方案。学生具有自主性，易于调动其积极性。黑龙江八一农垦大学的生物技术专业依托于省级重点专业，以农业微生物及技术作为重要的研究方向。在综合设计性实验中紧密结合专业方向，针对生物技术专业所涉及的科学问题设立“生物信息学”的实验内容。例如，“土壤微生物扩增子高通量测序数据的获得与分析”实验结合环境生物技术专业课程的土壤微生物生态研究，要求学生挑选自己感兴趣