疣蝗肠道好氧细菌分离及ARDRA多态性分析.docVIP

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疣蝗肠道好氧细菌分离及ARDRA多态性分析

疣蝗肠道好氧细菌分离及ARDRA多态性分析   摘要:将疣蝗中肠样品倍比稀释后涂布平板分离菌株,共分离得到11株好氧细菌。以细菌基因组DNA为模板,用细菌16S rDNA通用引物(27f,1492r)对模板扩增,并用4种限制性内切酶HaeⅢ 和 HindⅢ、HinfⅠ和TaqⅠ对PCR扩增产物进行ARDRA多态性分析。对聚类图谱的分析结果发现,11株好氧细菌在 82%的水平上聚成 3个不同分类操作单元(OTU),表明疣蝗肠道内好氧细菌的遗传多样性水平偏低。   关键词:肠道细菌,多样性,ARDRA,疣蝗      疣蝗 Trilophidia annulata (Thunberg)隶属直翅目(Orthoptera)斑翅蝗科(Oedipodidae)疣蝗属(Stal),在我国只有疣蝗一个种[1],作为一种农业害虫广泛分布在吉林、海南、云南、陕西、贵州等省,主要危害苜蓿、水稻、甘蔗、橡胶苗和多种蔬菜,是一个广布种。2005年海南蝗灾大爆发,虫口密度有时高达2 500头/m2以上,水稻和甘蔗遭受巨大损失[2]。???前蝗虫主要采用天敌、化学农药和绿僵菌等防治措施,环境污染严重,效果受天气影响较大。因此大力开发稳定性较好的生物农药非常必要。   昆虫肠道中存在的微生物菌群与昆虫的营养、免疫等生理活动密切相关[3]。肠道微生物的改变直接影响昆虫的进食、生长发育,因此近年来,动物肠道微生态的研究已成为热点。有研究表明,利用肠道微生物的改变能够提高家蚕、日本龟蜡蚧等昆虫的经济价值[4,5]。关于蝗虫肠道微生物的研究目前仅见于东亚飞蝗肠道细菌的鉴定[6,7],而疣蝗肠道微生物的研究尚未见报道。   本研究通过涂布平板法,从疣蝗肠道中分离出可培养好氧细菌,研究疣蝗肠道内好氧细菌的多样性,为研究蝗虫与肠道微生物的关系提供科学依据;为后期利用肠道弱势菌群饲喂疣蝗,改变其肠菌多样性,影响其生长发育、杀虫等提供种质资源,以期开发出新的杀虫效力稳定的生物杀菌剂。      1材料与方法      1.1昆虫样品   采自西南林业大学树木园内的健康疣蝗(Trilophidia annulata)   1.2培养基与试剂   平板分离纯化培养基:营养肉汤培养基;纯化培养基:牛肉膏蛋白胨培养基   细菌基因组DNA提取试剂盒、PCR试剂、限制性内切酶等购自TIANGEN公司   1.3细菌的分离和纯化   将疣蝗仅用无菌水饲养3d,排尽其肠道食物。剪掉翅膀和足,将虫体于升汞溶液中浸泡5min,期间用镊子翻动虫体,使消毒彻底。再用无菌水冲洗虫体5min,重复3次。在无菌条件下解剖疣蝗取中肠,研磨捣碎后加1ml无菌水制成肠道匀浆悬液,备用。将肠道匀浆液按1×(10-1~10-8)用无菌水倍比稀释,各取1ml涂布于营养肉汤平板上,置于28℃培养箱中培养7d。挑取单菌落在牛肉膏蛋白胨培养基平板上划线纯化。纯菌株于4℃斜面保藏。所有数据重复3次。   1.4菌体总DNA提取   用细菌基因组DNA提取试剂盒提取好氧细菌单菌落的基因组DNA。   1.516S rDNA扩增   以16S rRNA的通用引物进行PCR扩增。正向引物27f(5`-AGA GTT TGA TCC TGG CTC AG-3`)和反向引物1492r(5`-TAC GGC TAC CTT GTT ACG ACT T-3`)。反应体系:10×PCR Buffer 5μl,MgCl2 3μl,dNTP 1μl,引物各1μl,DNA模板1μl,Taq酶(5U/μl)0.5μl,无菌水补足50μl。反应条件:94℃预变性5min;94℃ 1min,56℃ 1min,72℃ 3min,30个循环,72℃最终延伸5min。0.8%琼脂糖凝胶电泳检测PCR产物。   1.6ARDRA分析   用两组4种限制性内切酶对16S rRNA基因扩增产物进行酶切。   1.6.1HaeⅢ 和 HindⅢ的酶切   反应体系:HaeⅢ 1μl;Hind 1μl;10×M Buffer 2μl;DNA 10μl; 灭菌水补足20μl。反应条件:37℃过夜,0.8%琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物。   1.6.2HinfⅠ和TaqⅠ的酶切   反应体系:HinfⅠ1μl;TaqⅠ1μl;10×TaqⅠBasal Buffer 2μl;0.10%BSA 2μl;DNA 10μl;灭菌水补足20μl。反应条件:37℃ 2~3h,65℃ 2h,0.80%琼脂糖凝胶电泳检测酶切产物。   1.6.3多态性分析   用软件labimage2.0将琼脂糖凝胶上出现的DNA带谱转化为分子量信息,按“出现”记为1,“不出现”记为0,进行统计。模糊条带及分子量小于80bp的条带忽略不计。根据条

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