原创力文档- 1、本文档共23页，可阅读全部内容。
- 2、原创力文档（book118）网站文档一经付费（服务费），不意味着购买了该文档的版权，仅供个人/单位学习、研究之用，不得用于商业用途，未经授权，严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等，侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传，本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺！文档内容仅供研究参考，付费前请自行鉴别。如您付费，意味着您自己接受本站规则且自行承担风险，本站不退款、不进行额外附加服务；查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档，您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等，请点击“版权申诉”（推荐），也可以打举报电话：400-050-0827(电话支持时间：9:00-18:30)。
查看更多
项目编号：
细菌基因组完成图
结题报告
成都生命基线科技有限公司
Chengdu life baseline technology co., LTD
项目编号：
目录
一、工作流程3
1.1 Illumina Hiseq 测序实验流程3
1.1.1 测序流程3
1.1.2 流程说明3
1.2 单分子PacBio 测序实验流程4
1.2.1 实验流程4
1.2.2 流程说明4
1.3 生物信息分析流程6
二、 项目结果报告7
2.1标准生物信息学分析7
2.1.1 原始测序数据说明7
2.1.2 原始测序数据质控7
2.1.3 原始测序数据质量剪切 8
2.1.4 测序数据统计9
2.1.5 基因组组装9
2.1.6 rRNA/tRNA 查找 11
2.1.7 基因预测 11
2.1.8 基因功能注释 11
各数据库结果汇总表 11
COG 功能分析 12
KEGG 通路分析 13
GO 注释统计 13
Swiss-Prot 数据库注释 14
2.1.9 抗性/耐药基因分析 14
2.1.10 碳水化合物相关酶（CAZy ）的基因注释 15
2.2个性化生物信息学分析 15
2.2.1 基因组圈图 15
2.2.2 基因组GeneBank 提交数据文件生成及提交 16
2.2.3 GI 岛预测 17
2.2.4 次级代谢及生物合成基因簇注释 17
2.2.5 蛋白质信号肽预测 18
2.2.6 蛋白质跨膜domain 预测 18
2.2.7 比较基因组学分析 19
同源基因分析 19
全基因组进化树构建 19
共线性分析 19
三、附录21
3.1 附件说明21
3.2 文件解压缩方法22
3.3 文件打开或浏览方法22
成都生命基线科技有限公司
Chengdu life baseline technology co., LTD
2
项目编号：
一、工作流程
1.1 Illumina Hiseq 测序实验流程
1.1.1 测序流程
基因组DNA →→ 片段化 →→ 文库构建 →→ 桥式PCR →→ Illumina Hiseq 测序
1.1.2 流程说明
基因组DNA 收集
完成基因组DNA 抽提后，利用 1%琼脂糖凝胶电泳检测收集基因组DN
文档评论（0）