SSR标记和扁穗牛鞭草农艺性状关联分析.docVIP

SSR标记和扁穗牛鞭草农艺性状关联分析 　　摘要：利用ＳＳＲ引物对４４份外部形态差异较大的扁穗牛鞭草基因组进行扫描，结合农艺性状，进行性状与标记间的关联分析。结果表明，①扁穗牛鞭草群体的农艺性状存在较大变异，其中分蘖数变异最大，变异系数达３４．８％，其次是单株生物量、叶长和茎叶比，变异系数也达２０％以上。②扁穗牛鞭草农艺性状间存在显著的相关关系，单株生物量与叶宽、茎直径、茎长呈极显著正相关，茎叶比与节间长、茎长呈极显著正相关，与分蘖数呈极显著负相关。③通过单向分组资料的方差分析，从１８２条多态性条带中共检测到与扁穗牛鞭草８个农艺性状极显著相关的ＳＳＲ标记１８个，其中，６个标记分别与２个以上性状关联。标记对性状变异的贡献率为１５．１％～３２．８％，ＳＧ５－１６０能解释３２．８％节间长表型变异，引物ＳＧ２５的４个标记对茎直径表型变异的总贡献率达９１．６％。该研究结果对早期发现优异种质，缩小筛选范围，降低筛选成本和工作量，加快扁穗牛鞭草育种进程有重要意义。 　　关键词：扁穗牛鞭草；ＳＳＲ标记；农艺性状；关联分析 　　中图分类号：Ｓ５４；Ｑ７８文献标识码：Ａ文章编号：0439－８114（２０11）07－1494-05 　　 　　Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ Ａｎａｌｙｓｉｓ ｂｅｔｗｅｅｎ ＳＳＲ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Markers ａｎｄ Ａｇｒｏｎｏｍｉｃ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｓ ｏｆ 　　Ｈｅｍａｒｔｈｒｉａ ｃｏｍｐｒｅｓｓａ 　　 　　ＣＨＥＮ Ｙｏｎｇ－ｘｉａ１，２，ＺＨＡＮＧ Ｘｉｎ－ｑｕａｎ２，ＭＡ Ｘｉａｏ２，ＸＩＥ Ｗｅｎ－ｇａｎｇ２ 　　（１． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ，Ｘｉｃｈａｎｇ Ｃｏｌｌｅｇｅ， Ｘｉｃｈａｎｇ ６１５０００，Ｓｉｃｈｕａｎ，Ｃｈｉｎａ； 　　２． Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ａｎｉｍａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｓｉｃｈｕａｎ Ａｇｒｉｃｕｌｔｕｒａｌ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｙａ’ａｎ ６２５０００，Ｓｉｃｈｕａｎ，Ｃｈｉｎａ） 　　 　　Ａｂｓｔｒａｃｔ： ８ ａｇｒｏｎｏｍｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｓ ｏｆ ４４ Ｈｅｍａｒｔｈｒｉａ ｃｏｍｐｒｅｓｓａ ｍａｔｅｒｉａｌｓ ｗｅｒｅ ｍｅａｓｕｒｅｄ ａｎｄ １０ ｐａｉｒｓ ｏｆ ＳＳＲ ｐｒｅｍｉｅｒｓ ｗｅｒｅ ｕｓｅｄ ｔｏ ａｍｐｌｉｆｙ ｔｈｅ ｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡ ｏｆ ｔｈｅｓｅ ｍａｔｅｒｉａｌｓ． Ｓｉｎｇｌｅ ｆａｃｔｏｒ ｖａｒｉａｎｃｅ ａｎａｌｙｓｉｓ ｗａｓ ｕｓｅｄ ｔｏ ｉｄｅｎｔｉｆｙ ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｑｕａｎｔｉｔｉｖｅ ｔｒａｉｔｓ ａｎｄ ＳＳＲ ｍｏｃｕｌａｒ ｍａｒｋｅｒｓ． Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｓｈｏｗｅｄ ｔｈａｔ： ① ｔｈｅｒｅ ｗｅｒｅ ｖａｒｉｏｕｓ ｖａｒｉａｂｉｌｉｔｙ ａｍｏｎｇ Ｈ．ｃｏｍｐｒｅｓｓａ ｇｅｒｍｐｌａｓｍ． Ｔｈｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｏｆ ｔｉｌｌｅｒｓ ｗａｓ ３４．８％． Ｔｈｅ ｖａｒｉａｔｉｏｎ ｃｏｅｆｆｉｃｉｅｎｔ ｏｆ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ ｂｉｏｍａｓｓ， ｌｅａｆ ｗｉｄｔｈ ａｎｄ ｓｔｅｍ－ｌｅａｆ ｒａｔｉｏ ｗａｓ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ ２０％． ②Ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｗａｓ ｆｏｕｎｄ ａｍｏｎｇ ｔｈｅｓｅ ａｇｒｏｎｏｍｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｓ． Ｔｈｅｒｅ ｗｅｒｅ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｐｏｓｉｔｉｖｅ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ ｂｉｏｍａｓｓ ａｎｄ ｌｅａｆ ｗｉｄｔｈ， ｓｔｅｍ ｄｉａｍｅｔｅｒ， ｂｒａｎｃｈ ｌｅｎｇｔｈ， ａｎｄ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｐｏｓｉｔｉｖｅ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｓｔｅｍ－ｌｅａｆ ｒａｔｉｏ ａｎｄ ｉｎｔｅｒｎｏｄｅ ｌｅｎｇｔｈ， ｂｒａｎｃｈ ｌｅｎｇｔｈ． Ｈｏｗｅｖｅｒ， ｔｈｅ ｃｏｒｒｅｌａｔｉｏｎ ｂｅｔｗｅｅｎ ｓｔｅｍ－ｌｅａｆ ｒａｔｉｏ ａｎｄ ｔｉｌｌｅｒｓ ｗａｓ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ｎｅｇａｔｉｖｅ． ③Ｔｈｅ ｒｅｓｕｌｔ ｏｆ ｏｎｅ－ｗａｙ ＡＮＯＶＡ ｒｅｖｅａｌｅｄ ｔｈａｔ １８ markers ｏｕｔ ｏｆ ｔｈｅ ｔｏｔａｌ １８２ ＰＣＲ ｐｒｏｄｕｃｅｄ ｂａｎｄｓ ｗｅｒｅ ｓｉｇｎｉｆｉｃａｎｔｌｙ ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ８ ａｇｒｏｎｏｍｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｓ， ａｍｏｎｇ ｗｈｉｃｈ ６ markers ｗｅｒｅ ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｗｉｔｈ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ ２ ｔｒ