肠癌和肝癌特征代谢模式研究-药剂学专业论文.docxVIP

(O)PLS-DA 分析 27 3.2.3 模型质量评价 28 主成分个数的确定 28 七次循环交互验证（7-fold cross validation） 29 响应排序检验（response permutation testing, RPT） 29 CV-ANOVA 30 费歇尔线性（FLDA ）判别分析 31 3.2.4 “多标准”筛选差异性变量 31 3.2.5 单维分析 33 单维/多维分析结果 33 单维/多维方法比较 34 动物实验和临床试验的代谢组学数据比较 34 3.3 本章小结 36 第四章 肝癌和肠癌血清代谢模式分析 38 4.1 肝癌和肠癌两种疾病独立分析 39 4.1.1 独立建模分析 39 4.1.2 模型质量评价和验证 41 OPLS-DA 模型预测 42 FLDA 分析 43 差异性变量单维统计验证 45 4.1.3 相关性研究 45 4.2 “一对多”多维分析 48 4.2.1 肠癌 V.S. Rest, 肝癌 V.S. Rest, 正常 V.S. Rest 建模 49 4.2.2 差异性变量考察 50 单维统计验证 50 差异性变量考察 51 4.3 本章小结 55 第五章 研究工作总结与展望 56 5.1 研究工作总结 56 5.2 论文创新点 57 5.3 展望 57 致 谢 58 攻读硕士学位期间主要研究成果 59 参考文献 60 肠癌和肝癌特征代谢模式研究 摘 要 代谢组学是继基因组学、转录组学、蛋白质组学后诞生的一门新的 交叉学科，包括分析化学、化学计量学以及生理病理学等领域知识，是 系统生物学中的一个重要组成部分。基于“系统论”指导的代谢组学技术 通过研究能够反映机体整体生理病理状态的血清或尿液，能从整体代谢 水平上提供一个新视角去理解受多因素影响的复杂疾病的发生、发展机 制。但迄今为止，代谢组学技术应用于各种疾病的研究模式主要是基于 “疾病和对照”两组样本进行研究（也称“比较代谢组学”)，有关多种疾病 诊断或者疾病特征代谢模式研究很少。而且，化学计量学作为代谢组学 技术重要的组成部分，有关就采用化学计量学进行代谢组学数据处理方 法的实验性研究至今很少。 因此，本文的研究工作主要包括两个部分： 第一，全面研究代谢组学数据结构特点，讨论和比较各种数据处 理方法的优缺点。在数据预处理、模式识别、模型验证、变量筛选等方 面严谨的指导原则。 第二，分别采用两种策略（“一对一”相关性研究和“一对多”分 析）进行肠癌、肝癌的特征代谢模式研究，寻找区分两种恶性肿瘤的特 异性和共有性变量，为生物标志物筛选和多种疾病诊断疾提供研究思 路。 关键词：代谢组学，肠癌，肝癌，化学计量学，特征代谢模式 I STUDY ON SPECIFIC METABOLIC PROFILES OF COLORECTAL CANCER AND LIVER CANCER ABSTRACT Metabonomics (metabolomics or metabolic profiling), concomitant with genomics, metagenomics, and proteomics etc., is a newly thriving systems biology. It is an interdisciplinary science requiring proper expertise in biological sciences, analytical chemistry and chemometrics. Metabonomics is generally defined as “the multi-parametric metabolic responses of a living system to pathophysiological stimuli or genetic modifications”. Through the global analysis of biofluids such as serum or urine that could reflect the pathophysilogical status, the ‘systems biology’ based Metabonomics will provide a new insights in exploring the onset and progression for complex disease. However, metabonomic studies generally investigate the “case- contr