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草鱼Trap1基因克隆及其在草鱼呼肠孤病毒感染过程中的抗细胞凋亡作用-临床兽医学专业论文
上海海
上海海洋大学硕士学位论文
万方数据
万方数据
上海海洋大学硕士学位论文
答辩委员会成员名单
姓名
工作单位
职称
备注
何亚文
上海交通大学
教授
徐鸿绪
中山大学
教授
杨先乐
上海海洋大学
教授
赵金良
上海海洋大学
教授
谢骏
淡水渔业研究中心
研究员
答辩地点
上海海洋大学病原库
答辩日期
2015.06.02
摘 要
草鱼呼肠孤病毒(grass carp reovirus,GCRV)是引发草鱼出血病的主要病原, 严重影响我国草鱼养殖行业的发展。GCRV 属于呼肠孤病毒科水生呼肠孤病毒属 的双链 RNA 病毒,基因组分 11 个阶段,共编码 12 个蛋白。GCRV 能引起宿主细 胞基因转录水平和蛋白合成的变化,还会引起细胞融合、细胞凋亡等症状。细胞 凋亡是受基因调控的一种细胞程序性死亡形式,许多病毒能够诱导细胞凋亡,细 胞凋亡与病毒之间具有双向作用,宿主细胞能够通过细胞凋亡抑制病毒的感染, 而病毒能够通过细胞凋亡释放病毒粒子。
本文通过各种细胞凋亡检测技术对 GCRV 感染过程中 CIK 细胞的凋亡现象进 行了研究,通过 2-D 电泳、RACE、RT-PCR 等技术对草鱼 Trap1 基因进行了鉴定 分析,并对其在 GCRV 诱导的 CIK 细胞凋亡中的作用进行了初步探讨。主要包括 以下三个方面:
(1)GCRV 诱导 CIK 细胞凋亡的检测。本研究主要通过不同方法检测 GCRV 感染 CIK 细胞过程中的细胞凋亡现象。用 MOI=10 的 GCRV 病毒感染 CIK 细胞 12 h 后,通过 DAPI 染色,检测到了明显的凋亡小体。用 MOI=1 的 GCRV 病毒感染 CIK 细胞 0、3、6、12、24、36、48 和 60 h 后,分别提取不同时间点的基因组 DNA, 然后通过凝胶电泳进行分析,结果显示,在感染 24 h 后能看到明显的 DNA 梯形条 带。TUNEL 检测试验也表明,用 MOI=5 的 GCRV 感染 CIK 细胞 12 h 和 24 h 后 都能检测到明显的凋亡信号。同时,RT-PCR 结果也表明,用 MO1=1 的 GCRV 感 染 CIK 细胞不同时间点后,细胞内的 Bax/Bcl-2 和 Caspase-3 表达量分别在 8 h 和 12 h 开始上调。此外,用 MOI=1 的 GCRV 病毒感染 CIK 细胞 12、24、36 和 48 h 后,膜联蛋白标记之后通过细胞分析仪进行细胞凋亡的定量检测,结果显示,在 病毒感染过程中细胞凋亡率逐渐上升并明显高于对照组。
(2)草鱼 Trap1 基因的蛋白组学鉴定、克隆表达及分析。本研究通过对 GCRV 感染 24 h 后与未感染的 CIK 细胞全蛋白进行双向电泳和质谱鉴定对比分析,结果 显示,蛋白点 1061 为草鱼 Trap1 蛋白,且病毒感染 24 h 后的草鱼 Trap1 蛋白表达 水平是未感染的 3 倍以上。进一步通过 RACE 扩增技术,得到了 2762 bp 的草鱼 Trap1 基因全长,包含 2157 bp 的开放阅读框,编码 718 个氨基酸。同源性分析结 果显示草鱼 Trap1 与斑马鱼 Trap1 同源性达到 87%。将 Trap1 基因插入到 pEGFP-N1 载体质粒后进行亚细胞定位实验,结果显示草鱼 Trap1 蛋白主要在细胞质中表达, 蛋白表达通过 Western Blot 实验进行验证。在 Poly(I: C)刺激和 GCRV 感染不同时
I
间点后,CIK 细胞中的 Trap1 基因转录水平均出现上调。
(3)草鱼 Trap1 基因调控病毒诱导的细胞凋亡。本研究为了探讨草鱼 Trap1 基因在 GCRV 诱导 CIK 细胞凋亡中的作用,先从草鱼 CIK 细胞 cDNA 中扩增出了 与 Trap1 相互作用并参与细胞凋亡调控的两个因子 PINK1 和 Sorcin 的基因片段, 并且在 GCRV 感染 CIK 细胞过程中,PINK1 和 Sorcin 的转录水平表达均上调。针 对 Trap1 基因,设计三条特异性的 siRNA,并通过 qRT-PCR 筛选出沉默效果较好 的 CiTrap1-siRNA2 进行下游实验。GCRV 感染 siRNA 处理后的 CIK 细胞,36 h 后定量检测细胞凋亡率,结果显示,siRNA 处理组细胞凋亡率明显高于未处理或 阴性 siRNA 处理组。
本研究通过不同方法检测 GCRV 感染 CIK 细胞的凋亡现象,结果表明 GCRV 能够诱导 CIK 细胞凋亡,然后通过双向电泳与质谱分析技术鉴定出了具有抗凋亡 作用的蛋白 Trap1,而后成功克隆得到了草鱼 Trap1 全长基因,并用 siRNA 基因沉 默方法初步证明了 Trap1 在 GCRV 感染 CIK 过程中起到
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