水稻抗病基因Lrr19类似物序列分析的研究.docVIP

水稻抗病基因Lrr19类似物序列分析的研究 　　摘要 根据GeneBank数据库中已知水稻抗病基因Lrr19类似物序列，设计引物，比较普通野生稻、粳稻和籼稻的基因序列，初步分析了3种水稻Lrr19类似物的序列差异，与小麦抗病基因Lrr19编码序列的同源性。结果发现在水稻不同品系间发生部分位点碱基的变化，相似性为97%～98%；水稻中该类似物编码的蛋白质与小麦的LRR19有较高的同源性（54%～55%），籼稻、粳稻和普通野生稻编码蛋白都在相同的位置存在NB-ARC和LRR结构域，并且与小麦LRR19蛋白相似。推测水稻Lrr19基因类似物是抗性相关基因，并且在水稻不同品种间序列差异不大，相对较为保守。 　　关键词 水稻；抗病基因；Lrr19；类似物 　　中图分类号 S511 文献标识码 A 文章编号 1007-5739（2013）15-0013-03 　　自1992年第1个植物抗病基因Hm1被克隆[1]以来，人们不断发现已克隆的抗病基因存在一些相似的结构域，如NBS、LRR、TIR、STK、LZ、CC等[2-5]。1996年Kanazin和Yu开展了使用这些结构域设计简并引物从基因组DNA中进行扩增的研究[6-7]。由于扩增的产物与抗病基因有较高的同源性，一些研究者将其分别称为抗性基因同源类似物Resistance gene analog（RGA）[6]。 　　亮氨酸富集重