中华猕猴桃EIN3EIL转录因子家族的成员鉴定、系统进化和基因表达模式.docVIP

PAGE1 / NUMPAGES11 中华猕猴桃EIN3/EIL转录因子家族的成员鉴定、系统进化和基因表达模式研究收稿日期 Received: 2017 接受日期 收稿日期 Received: 2017 接受日期 Accepted: 2017 *国家自然科学基金青年科学基金、国家自然科学基金面上项目、中国博士后科学基金面上基金（2013M541824）资助 Supported by National Natural Science Foundation of China , China Postdoctoral Science Foundation (2013M541824) ** Corresponding author (E-mail: huangshengxiong@163.com) 陈强1 刘建1 陈丹阳1 于丰源1 江梦柯1 郑玉凤1 牛向丽1 刘永胜1 黄胜雄1 ** 1合肥工业大学食品科学与工程学院 合肥 230009 摘要：EIN3/EIL家族属于一类非常重要的转录因子，调控了植物包括果实成熟在内的众多生长发育过程。本文对中华猕猴桃EIN3/EIL家族进行了系统的生物信息学和比较基因组学研究。在中华猕猴桃基因组中鉴定得到8个EIN3/EIL转录因子；其蛋白序列包括一个酸性氨基酸富集区，一个脯氨酸富集区，以及5-7个碱性氨基酸富集区。包括中华猕猴桃在内的20种植物的EIN3/EIL成员的系统进化树表明：EIN3/EIL基因在众多植物基因组中同时存在着趋同和趋异的进化趋势。中华猕猴桃EIN3/EIL基因家族成员的增加，主要源于其进化过程中发生的全基因组三倍化倍增事件。在果实成熟过程中，中华猕猴桃EIN3/EIL基因呈现组成型的高或低表达的两种截然相反的基因表达趋势。本研究结果期望为中华猕猴桃EIN3/EIL转录因子基因的功能研究，提供优良的候选基因以及坚实的数据基础。（图5 表2 参25） 关键词 中华猕猴桃；EIN3/EIL；系统进化；比较基因组学分析；基因表达模式 CLC Q349+.5 Analyses of genome-wide identification, phylogenetic evolution and gene expression pattern of EIN3/EIL transcription factors in Actinidia chinensis* CHEN Qiang1, LIU Jian1, CHEN Danyang1, YU Fengyuan1, JIANG Mengke1, ZHENG Yufeng1, NIU Xiangli1, LIU Yongsheng Liu1 HUANG Shengxiong1** 1 School of Food Science and Engineering, Hefei University of Technology, Hefei 230009, China Abstract Objectives: The EIN3/EIL transcription factors play key roles in plants, widely regulating plant growth and development, especially fruit ripening. Methods: In this study, the bioinformatics and comparative genomic studies were performed in the EIN3/EIL family genes of Actinidia chinensis. Results: Consequently, 8 EIN3/EIL genes were identified in the genome of A. chinensis. Their protein sequences include one highly acidic domain, one proline-rich domain, and 5 to 7 basic domains. In the phylogenetic tree of EIN3/EIL genes from 20 plant genomes, convergent and divergent evolution simultaneously existed in many plant species. The EIN3/EIL gene expansions in A. chinensis resul