稻属异源四倍体花色苷合成途径中调控基因R的遗传多态性分析-植物学专业论文.docx

I I 目录 摘 要 I Abstract II HYPERLINK \l _bookmark0 第一部分 综述 1 HYPERLINK \l _bookmark1 1.1 稻属植物研究背景简介 1 HYPERLINK \l _bookmark2 BBCC 基因组的多倍体 2 HYPERLINK \l _bookmark3 CCDD 基因组的多倍体 2 HYPERLINK \l _bookmark4 1.2 花色苷生物合成途径简介 4 HYPERLINK \l _bookmark5 1.2.1 植物花色苷生物合成途径 4 HYPERLINK \l _bookmark6 1.2.2 植物花色苷合成途径中的调控基因 R 基因 6 HYPERLINK \l _bookmark7 第二部分 实验材料和方法 10 HYPERLINK \l _bookmark8 2.1 植物材料 10 HYPERLINK \l _bookmark9 2.2 引物设计 11 HYPERLINK \l _bookmark10 2.3 实验方法 11 HYPERLINK \l _bookmark11 2.3.1 总 DNA 提取 11 HYPERLINK \l _bookmark12 2.3.2 PCR 扩增和纯化回收 12 HYPERLINK \l _bookmark13 2.3.3 克隆 13 HYPERLINK \l _bookmark14 2.3.4 序列测定 14 HYPERLINK \l _bookmark15 2.4 数据处理 15 HYPERLINK \l _bookmark16 2.5 Eco52Ⅰ和 XhoⅠ区分 C 和 D 基因组 15 HYPERLINK \l _bookmark17 2.5.1 基因的单链克隆 PCR 扩增 15 HYPERLINK \l _bookmark18 2.5.2 Eco52Ⅰ和 XhoⅠ酶切的限制性片段差异 16 HYPERLINK \l _bookmark19 第三部分 研究结果及讨论 17 HYPERLINK \l _bookmark20 3.1 生物信息学分析结果 17 HYPERLINK \l _bookmark21 3.2 总 DNA 的提取、PCR 扩增、质粒酶切和 DNA 测序 19 HYPERLINK \l _bookmark22 3.3 稻属异源四倍体 R 基因片段的分子进化分析 20 HYPERLINK \l _bookmark23 3.3.1 稻属具有 BBCC 基因组四倍体 R 基因片段的遗传多态 21 HYPERLINK \l _bookmark24 3.3.2 稻属具有 CCDD 基因组四倍体 R 基因的分子进化 23 HYPERLINK \l _bookmark25 3.4 讨论 26 HYPERLINK \l _bookmark26 参考文献 28 HYPERLINK \l _bookmark27 致谢 35 PAGE PAGE 10 稻属异源四倍体花色苷合成途径调控基因 R 的遗 传多态性分析 第一部分 综述 1.1 稻属植物研究背景简介 稻属(Oryza L.)是禾本科（Gramineae）中的一个小属，仅包括 24 个物种[1]，其中 2 种 为栽培作物，即光稃稻（O. glaberrima Steud.）和亚洲稻（O. sativa L.）。光稃稻原分布于 非洲撒哈拉沙漠以南，通常被认为在 2000-3000 年前由居住在尼日尔河泛滥平原的原居民 由巴蒂野生稻（O. barthii A. Chev.）驯化而来[2,3]；而亚洲稻内的两个亚种：粳稻（O. sativa subsp. japonica）和籼稻（O. sativa subsp. indica）则可能是在中国南方被独立驯化[4,5]。目 前，光稃稻已经日渐被亚洲稻取代，仅在西非有部分农民仍在种植。但是这两个物种已经 被成功杂交并产生了非常有前途的杂交种[6]。由于栽培水稻供养着世界上半数以上的人口 [7]，因此在世界粮食安全中扮演着举足轻重的角色；与此同时，作为单子叶植物的典型代 表，比较完备的基因组和表达序列标签等信息储备也使栽培稻、特别是亚洲栽培稻一跃成 为分子生物学和遗传学研究的模式植物。但是，长期的驯化和定向选择已经使栽培稻的遗 传多样性大量流失。因此，在日益强调提升粮食产量和品质的今天，如何拓宽栽培稻的遗 传背景，寻找新的有益基因已经成为众多育种学家迫在眉睫的工作。稻属内野生种类在长 期的进化和与自然抗争的过程中积累了丰富的遗传资源，自然成为栽培稻品质改良不可多 得的重要基因库。目前，在野生稻，