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随机扩增多态性DNA技术对湘产蛇莓种质资源的遗传多样性.PDF
随机扩增多态性DNA 技术对湘产蛇莓种质资源的遗传多样性分
析Δ
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刘湘丹 ,高 昱,张亚利,蔡嘉洛,童巧珍,张聪子(湖南中医药大学药学院,长沙 410208)
中图分类号 S567.2 文献标志码 A 文章编号 1001-0408(2015)19-2628-04
DOI 10.6039/j.issn. 1001-0408.2015.19.11
摘 要 目的:研究湘产蛇莓种质资源的遗传多样性。方法:建立不同地理分布的蛇莓种质资源随机扩增多态性DNA (RAPD )反
应体系,RAPD-聚合酶链反应(PCR )法检测湘产24组蛇莓样本(21个野生品,3个栽培品),琼脂糖凝胶电泳分析结果,计算等位基
因数(Na )、有效等位基因数(Ne )、多态性位点百分比(PPB)、Nei ’s 基因多样性指数(H)、Shannon’s信息指数(I)。结果:筛选出多态性
引物14条,共扩增出90条电泳谱带,其中多态带为81条,Na 为1.9000,Ne 为1.5401,PPB 为90.0%,H 为0.3128,I 为0.4675。结论:
湘产蛇莓各区域样本间遗传多样性丰富,人工栽培品与野生品之间存在遗传背景上的差异,聚类结果与地理分布表现出明显相关性。
关键词 蛇莓;种质资源;随机扩增多态性脱氧核糖核酸;遗传多样性;聚类分析;聚合酶链反应
Analysis of the Genetic Diversity of Germplasm Resources of Duchesnea indica from Hunan by Random
Amplified Polymorphic DNA
LIU Xiang-dan ,GAO Yu ,ZHANG Ya-li ,CAI Jia-luo ,TONG Qiao-zhen ,ZHANG Cong-zi (School of Pharmacy ,
Hunan University of Chinese Medicine ,Changsha 410208,China )
ABSTRACT OBJECTIVE :To study the genetic diversity of germplasm resources of Duchesnea indica from Hunan. METHODS :
The random amplified polymorphic DNA (RAPD )reaction system of germplasm resources was established and RAPD-PCR was ad-
opted to detect the expressions of 24 groups of D. indica from Hunan (including 21wild and 3 cultivated varietos in different geo-
graphical distribution ). Agarose gel electrophoresis was used to analyze the results and calculate allele number (Na ),effective al-
lele number (Ne )the polymorphism points percentage (PPB ),Nei ’s gene diversity index (H )and Shannon ’s information index
(I ). RESULTS :Totally 14polymorphic primers were screened and 90 electrophoresis bands were amplified ,including 81polymor-
phic bands with Na of 1.900 0,Ne of 1.540 1,PPB of 90.0%,H of 0.3128and I of 0.467 5. CONCLUSIONS :The genetic diver-
sity of D. indica from Hunan is rich ,and there were differences in gen
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