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利用SSR标记划分144份玉米自交系的杂种优势群
摘要:利用SSR标记对144份玉米自交系遗传多样性进行研究,初步进行了杂种优势群划分。从224对SSR引物中筛选出90对扩增带型稳定且具有多态性的引物,从供试材料中共检测到424个多态性位点,每个SSR标记的等位基因数为2~10,平均为4.71个;多态性信息量为0.11~0.82,平均为0.53。利用UPGMA方法将144份自交系划分为2大类,5个亚群,分析结果与系谱分析基本一致。
关键词:玉米自交系;SSR标记;遗传多样性;杂种优势群
中图分类号:S513.03 文献标识号:A 文章编号:1001-4942(2018)09-0001-06
Abstract Genetic diversity of 144 maize inbred lines was studied by SSR markers, and the heterotic groups were preliminarily classified. Ninety pairs of primers with stable and polymorphic bands were screened from 224 pairs of SSR primers. A total of 424 alleles were detected out from the tested materials. Two to ten alleles per SSR marker were detected out, and the mean was 4.71. The polymorphism information content (PIC) for the SSR loci varied from 0.11 to 0.82 with the mean of 0.53. The 144 inbred lines were divided into 2 groups and 5 subgroups by UPGMA method. The analysis results were consistent with the pedigree analysis.
Keywords Maize inbred line; SSR marker; Genetic diversity; Heterotic group
玉米杂种优势类群划分和杂种优势模式构建是玉米自交系选育和杂交组合组配的重要依据,对提高玉米育种效率具有重要意义。20世纪80年代以来,育种家利用形态标记、细胞学标记、配合力表现[1]以及系谱分析等方法[2]进行了类群划分,但由于人工选择和遗传漂移的作用及系谱资料的不完整性等原因,这些方法在进行遗传变异分析时均表现出了一定的局限性[3]。近年来,分子标记技术快速发展,为自交系杂交优势群的划分提供了一定的分子学依据,使划分结果更准确。国内外学者利用RFLP、RAPD、SSR、AFLP等分子标记分别对亲缘关系明确的玉米材料进行杂种优势群划分,所得结果与系谱资料基本吻合[4-7]。
SSR标记是建立在PCR反应基础之上的一种遗传标记,以多态性丰富、共显性遗传、重复性高、稳定可靠、操作简单等优点,被广泛应用于玉米种质的遗传多样性研究[8]。李新海[9]和袁力行[10]等均将SSR标记应用于玉米自交系的遗传变异研究,划群结果与其系谱关系基本一致。本研究利用90对SSR引物研究了144份玉米自交系的遗传多样性,旨在对新选、引育的优良自交系进行杂种优势群划分,为种质改良、扩增和创新及杂交组合的亲本选配提供理论依据和技术支持。
1 材料与方法
1.1 供试材料
所选用的144份玉米自交系由山东省农业科学院玉米研究所提供,该自交系均为连续多代自交,性状稳定(表1)。
1.2 SSR标记分析
1.2.1 DNA提取 采用混合取样法从每份玉米自交系的植株上剪取幼嫩叶片,采用CTAB法[11]提取基因组DNA,用NaNoDRop 2000分光光度计检测DNA质量和浓度,并把浓度调至50 ng/μL,-20℃保存备用。
1.2.2 SSR引物筛选 从MaizeGDB和文献中选择均匀分布在玉米10条染色体上的224对SSR引物,由上海生工生物工程技术服务有限公司合成,再通过电泳从中筛选出带型稳定、多态性高的引物用于试验。
1.2.3 PCR和电泳检测 采用10.0 μL反应体系,包括Mix 5.0 μL,10 ng/μL引物各0.2 μL,模板DNA 1.0 μL,ddH2O 3.6 μL。
PCR反应程序为:94℃预变性5 min;94℃变性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸30 s,30个循环;72℃延伸10 min,4℃保存。PCR扩增产物用8.0%的非变性聚
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