毒理基因组学与系统毒理学.pptVIP

? 概述 ? 毒理基因组学研究技术平台 ? 毒理基因组学研究内容及其应用 ? 从毒理基因组学到系统毒理学 毒理基因组学（toxicogenomics）： 是研究生物体整个基因组与环境有害因素（化学因素、物理因素、生物因素）间的交互作用及其方式的一门新兴学科。 化学物质-毒物基因组学 毒理基因组学研究面临的基本挑战： 1.发展高通量筛选系统 如：DNA微阵列技术与芯片技术 2.大量生物学信息处理 如：DNA微阵列技术可测定上万个基因表达，获得约30万个数据，这些数据如何处理分析，又如何结合传统毒理学试验资料进行综合分析。 1.毒作用机制研究 2.化学物毒性预测 3.比较毒理学研究 4.混合物联合毒作用研究 5.危险度评定 6.表型锚定 7.信息整合 一、毒作用机制研究 除了急性坏死以外，几乎所有的毒作用都伴有相对应的基因改变，被改变的特有基因称“指纹基因”。 如：某外源化学物诱导细胞凋亡的机制研究中发现，p53基因↑、p21基因↑，Bax基因↑；Bcl-2基因↓等。 二、化学物毒性预测 通过基因微阵列分析基因组在mRNA水平上的改变，可以获得具有“诊断功能”的基因表达谱。 基本程序： ①选定已知毒物作为标准参照物； ②选定参照物已知或者可能作用的靶基因作为阵列目标基因； ③在特定细胞中用暴露参照物靶基因的表达谱与受试物的表达谱进行比较，预测毒作用类型； ④用统计学分类方法寻找两类毒物间的基因表达的差别。 利用“毒性指纹”可对化学物重新分类。 三、比较毒理学研究 理论基础： 人、大鼠与小鼠三种哺乳动物大约有90%的基因是相同的，采用高通量DNA微阵列技术，可以从大量或全部基因分子中筛选出合适的“桥梁生物标志物”(尤其是关键靶基因的表达产物)，用于比较不同物种间基因表达的相似性，从而更准确地将动物实验结果外推到人。 比较毒理基因组学数据库（CTD）-美国开发 四、混合物联合毒作用研究 将混合物染毒后的基因表达谱与单一化学物染毒后的基因表达谱进行比较，可分析不同化学物间的相互作用。 对未知毒作用的混合化合物，通过测定其混合物的基因表达图谱，并进行数据库检索，可预测混合化学物的毒作用方式以及有害效应的种类。 五、危险度评定 危险度评定包括危害识别、危害表证、暴露评定、危险度表征，毒理基因组学可用于危险度评定。 例如，对环境有害因素的危害识别，可利用基因芯片技术测定生物样品中由环境有害因素导致成千上万基因表达改变的影响。可阐明在不同接触时间和接触剂量下出现的基因毒作用（毒性指纹或指纹基因）。 注意：基因表达谱是分子事件在一定时空上的瞬时反应，分析毒作用的时间-效应关系十分重要。 六、表型锚定（phenotypic anchoring） 将化学毒物引起的特定基因图谱改变与其特定剂量或时间的毒性损害表现相联系的分析方法。 例如：化学性肝脏损伤时，血液中碱性磷酸酶（ALT）和天冬氨酸氨基转移酶（AST）水平增加，实际上是这些酶的相关基因表达水平发生了改变。 七、信息整合 有三层含义： 1.暴露某一化学物质后的同一个个体(动物或人)由不同技术平台（基因组学、转绿组学、蛋白质组学和代谢组学等）获得的测定结果进行比较分析，找出其联系与变化规律； 2.暴露某一化学物质的不同个体甚至不同物种的实验结果进行分析，找出相同或不同之处； 3.对不同实验室同一试验研究的结果进行对比分析，从而获得能够重复的并可进入公共数据库的可信资料。 系统毒理学 （system toxicology） 以毒理基因组学为基础，通过分析有害物质不同暴露（方式、剂量、时间等）后基因表达谱、蛋白质表达谱和毒物代谢谱的改变，结合传统毒理学的研究资料，利用生物信息学和计算机毒理学技术，系统研究外源有害因素与生物系统（细胞、组织、器官和生物机体整体水平）的交互作用及其毒作用机制。 美国毒理基因组学研究中心（NCT） 1.综合性数据库 -生物系统化学物效应知识库 （Chemical Effects in Biological Systems Knowledge base, CEBS） CEBS内容包括：基因组学、毒理学基因组学、传统毒理学实验资料数据库；蛋白质组学、代谢组学；SNP数据库；综合性分析模型等，分四个阶段进行。 2.毒性标签（Toxic signature） 是指机体内能指示或被识别有害因素