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基因预测的数字信号处理方法研究-应用数学专业论文

目录 HYPERLINK \l _bookmark0 1 绪论 1 HYPERLINK \l _bookmark1 1.1 课题的研究背景及意义 1 HYPERLINK \l _bookmark2 1.2 基因预测的研究现状及分析 2 HYPERLINK \l _bookmark3 1.3 基因预测的数字信号处理的研究现状 3 HYPERLINK \l _bookmark4 1.4 本文的研究内容及创新之处 5 HYPERLINK \l _bookmark5 2 基于小波技术下的傅里叶变换的基因预测方法 7 HYPERLINK \l _bookmark6 2.1 基于傅里叶技术下的基因预测方法 7 HYPERLINK \l _bookmark7 2.2 小波变换的理论 8 HYPERLINK \l _bookmark8 2.3 预测方法 10 HYPERLINK \l _bookmark9 2.4 结论 11 HYPERLINK \l _bookmark10 3 FIR 数字滤波器的改进设计 12 HYPERLINK \l _bookmark11 3.1 FIR 的设计的基本原理和步骤 12 HYPERLINK \l _bookmark12 3.2 基于改进后的设计数字滤波器基因预测 15 HYPERLINK \l _bookmark13 3.3 结论 18 HYPERLINK \l _bookmark14 4 一种双重去噪的基因预测算法 19 HYPERLINK \l _bookmark15 4.1 预测方法 19 HYPERLINK \l _bookmark16 4.2 实验与讨论 21 HYPERLINK \l _bookmark17 4.3 结论 24 HYPERLINK \l _bookmark18 5 抗逆基因序列的编码区预测 26 HYPERLINK \l _bookmark19 5.1 计算机实验 26 HYPERLINK \l _bookmark20 5.2 相关参数的选择 28 HYPERLINK \l _bookmark21 5.3 对比与讨论 30 HYPERLINK \l _bookmark22 6 结束语 31 HYPERLINK \l _bookmark23 参考文献 32 III 绪论 绪论 绪论 绪论 第 第 PAGE 1 页 共 36 页 第 第 PAGE 2 页 共 36 页 1 绪论 本节主要介绍了此次研究工作的背景、意义,以及创新之处,分析了基因 预测的研究现状,并且对基于数字信号处理的基因预测方法的研究现状进行阐 述,在本节最后给出了本文的研究内容。 1.1 课题的研究背景及意义 人类基因组计划自 1900 年在美国开展以来,基因测序工作迅速发展,尤其 是以人类与模式生物为首的基因组序列发展较为迅速。直至现在为止,大约已 3?109 有四十多种生物的全基因组基因序列完成测序工作,同时大概有 的人类基 因组的碱基对的测序工作已接近尾声。尤其是在 2006 年 6 月 26 日,被命名为 “阿波罗计划”的人类基因组计划,完成了该工作草图[1]。这是人类历史一次 有纪念意义的伟大事件,其实这和中、美、英,德、法、日科学院的艰苦努力 是分不开的,同时科学家们同时指出完成人类基因计划也已经指日可待。据我 们所知, Gene Bank 数据库中的 DNA 碱基数目每年以指数形式递增。同时在 人类基因计划进行的过程中,也积累了大量的经验和技术,这使得在进行其他 生物基因组的测序工作时,变得更为快捷。数据资源的急剧膨胀,而现有的方 法又有诸多的限制,所以迫使我们不得不考虑去寻求更有效的方法,对这些急 速增长的数据进行分析、处理,并对 DNA 序列上的基因结构进行完整的注释。 但是现在投入使用的方法,有很多的弊端和较多的限制条件,所以探索比较高 效的方法,成为现在相关专业科学家研究的热门重点问题。 目前,随着计算机技术的迅速发展,运算速度的快速提高,大量复杂的数 学公式变得越来越容易计算,这为数字信号处理技术提供了强有力保证。本文 将信息处理的理论和数学方法有效的结合,设计出一种新的信息处理方法,以 此来研究基因预测的有关问题,比如像预测抗逆基因序列的编码区、分析抗逆 基因序列的结构和功能,更好的揭示生命信息数据,推动生物信息学的发展。 这不仅仅为信号处理提供了新的研究领域,也将大大推动生命科学等相关学科 的发展。同时,还对医药、农学、食品和环境等领域产生较大的影响,并有可 能引发新的产业革命[2]。 本文选题源自于国家自然科学基金课题《生物抗逆基因的获取与处理》(编 号和新疆维吾尔自治区自然科学基金

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