基于降噪的谱聚类分析蛋白质算法及系统的研究与实现软件工程专业论文.docxVIP

优秀毕业论文 精品参考文献资料 分类号：TP391 分类号：TP391 单位代码：10422 密级： 学 号：201213234 ⑧ ∥礞办番 SHANDoNG UNI、僵RSITY 硕士学位论文 Thesis for Master Degree 论文题目：基于降噪的谱聚类分析蛋白质算法及系统 的研究与实现 THE RES队RCH AND l NPLEIIENTAT 1 0N 0F ALGOR l THN AND SYST日_0F PROTE l N’S SPECTRAL CLUSTER I NG黼YS I S队SED 0N NOISE-REDUCTl0N 作者姓名 秦琴 培养 单 位计算机科学与技术学院 专业 名 称 软件工程 指导 教 师 龚斌教授 合作 导 师 201 5年6月30日 万方数据 原创性声明本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独 原创性声明 本人郑重声明：所呈交的学位论文，是本人在导师的指导下，独 立进行研究所取得的成果。除文中已经注明引用的内容外，本论文不 包含任何其他个人或集体己经发表或撰写过的科研成果。对本文的研 究作出重要贡献的个人和集体，均已在文中以明确方式标明。本声明 的法律责任由本人承担。 论文作者签名： 差茎 Et 期： 丝签：垒21 关于学位论文使用授权的声明 本人同意学校保留或向国家有关部门或机构送交论文的印刷件和 电子版，允许论文被查阅和借阅；本人授权山东大学可以将本学位论 文的全部或部分内容编入有关数据库进行检索，可以采用影印、缩印 或其他复制手段保存论文和汇编本学位论文。 (保密论文在解密后应遵守此规定) 论文作者签名：翅 导师签名： 万方数据 山东大学硕士学位论文目 山东大学硕士学位论文 目 录 摘i耍 ．． ．I ABSTRACT ．．．III 第一章绪论 ．1 1．1研究背景 ．1 1．2研究现状 ．．3 1．3论文主要研究内容 ．6 1．4论文组织结构 ．．7 第二章相关知识和技术概括 9 2．1生物信息学 ．．9 2．2因子分析法与谱聚类算法 1 1 2．3 JSmol与前后端框架知识 ．13 2．4小结 。16 第三章系统的总体设计 ．17 3．1系统设计的目标 17 3．2系统设计的体系结构 18 3．3系统设计的关键技术 1 8 3．4小结 ．1 8 第四章寻找蛋白质中协同进化位点的算法 。20 4．1相关系数矩阵和位点降噪 21 4．1．1加权相关系数矩阵的构造 ．2l 4．1．2噪声位点的删除 ．22 4．2谱聚类分析 23 4．2．1数据准备部分 ．23 4．2．2确定特征向量数目一谱聚类中的K值 24 4．2．3谱聚类算法 ．25 万方数据 山东大学硕士学位论文4 山东大学硕士学位论文 4．3小结 ．26 第五章基于算法结果数据的检验与对比 ．27 5．1统计学检验 27 5．1．1结构元件的相关性检验 ．27 5．1．2结构元件的统计独立性检验 ．28 5．2生物学检验 29 5．3与其他算法的结果比较 30 5．4小结 ．32 第六章系统的设计与实现 33 6．1系统的实现部分 ．．： 33 6．1．1用户层 ．33 6．1．2逻辑处理层 ．35 6．1．3资源层 ．38 6．2小结 ．39 第七章总结与展望 40 7．1本文的工作总结 40 7．2展望 ．41 参考文献 43 致{射 47 万方数据 山东大学硕士学位论文CONTENTS 山东大学硕士学位论文 CONTENTS Abstract in Chinese．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．】【 Abstract in English．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．】【I Chapter I Introduction．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．． ．．．．．．．．．．．．．．．．．． ．．．．1 1．1 Background．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．． ．．．．．．1 1．2 Research actuality．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3 1．3 Main research co