微生物学通报中央戈壁石下生物土壤结皮中细菌群落结构和多样性.PDF

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微生物学通报中央戈壁石下生物土壤结皮中细菌群落结构和多样性

微生物学通报 Dec. 20, 2018, 45(12): 2603−2613 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.180041 研究报告 中央戈壁石下生物土壤结皮中细菌群落结构和多样性 贾丽娟 唐凯 兰慧青 徐黄纬 国情文 丁悦 谭芳 邢丽华 郭雨晴 冯福应* ( 010018) 摘 要:【背景】戈壁石下生物土壤结皮(Biological soil crusts ,BSCs) 中的微生物在干旱、半干 旱地区生态系统物质循环中起重要作用,其细菌群落结构和多样性因气候和地理环境的不同而 存在较大差异。中央戈壁面积大,其石下BSCs 中细菌群落结构和多样性却知之甚少。【目的】 比较中央戈壁石下BSCs 和周围裸土中细菌群落结构和多样性的异同,揭示环境因子对它们的 影响以及细菌之间的相互作用关系。【方法】利用Illumina MiSeq 对 16S rRNA 基因进行高通量 测序,使用生物信息学分析方法分析细菌群落结构和多样性及其影响因素;基于CoNet 软件绘 制物种共现性网络图,利用Cytoscape 3.5.1 软件将网络图可视化。【结果】石下BSCs 的速效磷 (Available phosphorus ,AP) 、速效氮(Available nitrogen ,AN)和叶绿素a (Chlorophyll a ,Chl a) 的含量均明显高于周围裸土(最高高出471%) ,而pH 则略低于周围裸土;石下BSCs 中细菌的 最优势菌门为 Cyanobacteria (45.85%−53.77%) ,优势属(9.25%−18.42%)有 Trichocoleus 、 Chroococcidiopsis 和属于 Cyanobacteria 纲的 1 个未知属;临近裸土中细菌的最优势菌门为 Actinobacteria (38.82%−44.69%) ,优势属(5%)有Arthrobacter 、Rubrobacter 和其它3 个属于放 线菌门或酸杆菌门的未知属;在土壤理化因子中,AP 对石下细菌群落组成的影响最大;除 Actinophytocola 属和Cyanobacteria 纲中的未知属外,其他微生物之间均存在较强的互作关系, 其中以共存的互作关系为主(约占60%) ,点度中心性、接近中心性和中介中心性均较高的节点 都属于Cyanobacteria 门和α-Proteobacteria 纲。【结论】中央戈壁石下BSCs 中的细菌群落结构 和多样性明显不同于临近裸土,Cyanobacteria 门和α-Proteobacteria 纲的细菌是该地区石下早期 BSCs 形成和发育最初及最重要的驱动力。 关键词:石下生物,16S rRNA 基因,高通量测序,物种共现性网络 Foundation items: National Natural Science Foundation of China ; Program for Young Talents of Science and Technology in Universities of Inner Mongolia Autonomous Region (NJYT-14-A05); Collaborative Innovation Team Project for Teachers and Students of College of Life Science of Inner Mongolia Agricultural University (KJCX2016011) *Corresponding author: Tel: 86-471-4309240; E-mail: fo

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