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β甘露聚糖酶基因的克隆表达及酶学性质研究微生物学专业论文
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摘要
类芽孢杆菌CH一3(Paenibacillus sp.CH-3)是本实验室从刺槐种子中筛选分离到的一 株植物内生菌,具有较强的∥.甘露聚糖酶活性,采用简并PCR和TAIL.PCR(thermal asymmetric interlaced PCR)技术从该菌基因组DNA中克隆得到∥.甘露聚糖酶基因 (manA)。序列分析表明,该基因开放阅读框(ORF)为984bp,编码一个含有327个氨基
酸、等电点为7.01、理论分子量约为35.270KDa的蛋白,N端前32个氨基酸为其信号肽。 同源性分析显示,该酶氨基酸序列与来源于Paenibacillus sp.A1 MANAl的氨基酸序列同 源性高达81.35%,属于糖苷水解酶5家族(GH5)的一员。通过对该酶分子三维结构的预 测分析,该酶的二级结构由14个a螺旋和15个居折叠股构成,其催化域采用一定的折叠方 式形成TIM桶状结构。
根据表达载体pET32a(+)或pET28a(+)的多克隆位点及目的基因序列特点,选择 BamH 1和Sal 1酶切位点处作为目的基因的插入位置,构建重组表达质粒pET.manA, 并将其转入大肠杆菌表达系统BL21(DE3),经过诱导获得了此酶的高效表达。对重组/3. 甘露聚糖酶酶活力进行初步检测,结果显示,酶活力可达90.34 U/ml。表达产物经
SDS—PAGE凝胶电泳分析,蛋白图谱显示1条大约为50.4KDa(pET28a表达系为
39.4I①a)的特异性条带。
实验探讨了温度、诱导物(IPTG)浓度和诱导时间三种单因素对重组.∥.甘露聚糖 酶基因工程菌产酶的影响,并在此基础上设计了正交组合试验,结果显示,该菌摇瓶发 酵的最佳条件组合为:发酵温度28℃,IPTG O.05 mM,诱导时间12 h,且在此发酵条 件下,酶活力可达1 054.17 U/mL,比初始酶活提高了约10.7倍。各因素对该菌产酶的
影响大小依次为诱导物(IPTG)浓度诱导时间互作项(温度×IPTG浓度)温度。 50 L发酵罐中进行该菌扩大培养试验,结果表明,在添加诱导物(IPTG)2 h后,届.甘 露聚糖酶的活力就己达到较高水平,诱导8 h后,酶活力达到最高,为1 917.96 U/ml, 比初始酶活力提高了约20.2倍。之后酶活力略有下降,但总体上来看保持稳定。
酶学性质研究表明,该菌所产的重组∥.甘露聚糖酶最适作用温度和pH分别为45
℃和7.0。该酶在35.45℃范围内酶活力比较稳定,50℃条件下保温30min后,酶活仍 保留74.23%,55℃保温30min后酶活基本丧失;pH 4.0.7.0条件下保温15 min酶活均
保留87.06%以上;Ca2+、Ba2+、M92+、Mn2+、C02+对该酶具有激活作用,其中以Ca2+
保留87.06%以上;Ca2+、Ba2+、M92+、Mn2+、C02+对该酶具有激活作用,其中以Ca2+ 的激活作用最为明显,可使酶活力提高约61%;Cu2+、 Zn2+、 EDTA和Fe2+对其具有 抑制作用。
枯草芽孢杆菌HD一1(Bacillus subtilis HD-1)是本实验室从黄豆种子中筛选分离到的 另一株植物内生菌,同样具有较强的∥.甘露聚糖酶活性,利用PCR技术从该菌基因组 DNA中克隆得到∥.甘露聚糖酶基因(manB),序列分析表明,该基因全长1089bp,N端 前27个氨基酸为其信号肽。该酶氨基酸序列与相同来源的届.甘露糖苷酶同源性最高达 98.34%,具有ManB保守结构域,属于糖苷水解酶家族26的一员。通过对该酶分子三 维结构的预测分析,该酶的催化域形成TIM桶状结构,Cys 92和Cys 112形成二硫键, 它们之间的部分构成该酶的氧化还原反应的活性中心。三维结构的分析为提高酶的催化 活性和功能方面的定向改造提供了依据。
关键词:内生,Paenibacillus sp.CH一3,夕-甘露聚糖酶,基因工程菌,酶学性质,Bacillus
subtilis HD—l
II
ABSTRAC
ABSTRAC T
Paenibacillus sp.CH一3 which had a high levelfl-mannanase activity was endophyte strain isolated from locust seed in 0111laboratory,the岱-marmanase encoding gene(manA)was isolated from it by degenerate PCR and TAIL-PCR.Sequence analys
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